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标题: 分子动力学模拟可以模拟小分子在细胞内的代谢过程吗? [打印本页]

作者
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lrx.mp3    时间: 2023-11-6 19:54
标题: 分子动力学模拟可以模拟小分子在细胞内的代谢过程吗?
各位老师好,想请教一个问题。已知一个小分子进入细胞所需的转运体,以及后续在细胞中发生代谢的相关酶,并且知道每一步代谢的中间体化合物,是否可以使用MD来模拟小分子从进入细胞开始到代谢结束的过程?

作者
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sobereva    时间: 2023-11-7 08:50
直接跑不可能。只能做多次MD,每次都用有限的模型体系做有限时间的模拟来考察整个过程中的某个关键过程
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lrx.mp3    时间: 2023-11-7 09:10
sobereva 发表于 2023-11-7 08:50
直接跑不可能。只能做多次MD,每次都用有限的模型体系做有限时间的模拟来考察整个过程中的某个关键过程

谢谢sob老师~ 这么一说我大概了解了




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