计算化学公社

标题: 请问怎么看确定药剂与团簇是否发生了氢键吸附？ [打印本页]

作者
Author: 茻苍 时间: 2023-11-10 14:48
标题: 请问怎么看确定药剂与团簇是否发生了氢键吸附？
各位老师、同学们好，我在做一个阳离子在矿物表面的吸附，吸附能为-33.34Kcal/mol，请问怎么看确定药剂与团簇是否发生了氢键吸附？
下面是我的工作流程：对钾长石（010）能量最低的面切晶面建立真空层，用castep进行几何预优化，然后超晶胞挖出团簇（保证团簇模型的化学计量比），使用dmol3对团簇进行几何优化（固定底层），将已优化的药剂分子放在团簇上，进行吸附，完成后计算吸附能。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-10 14:51
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）

IGMH非常清楚直观。而且支持周期性体系。用于周期性体系计算过程也可以参考下文（下文是NCI和IGM方法，IGMH和IGM的用法非常类似）
使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用
http://sobereva.com/588（http://bbs.keinsci.com/thread-21742-1-1.html）

更多信息见
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表！
http://sobereva.com/667（http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html）

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