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标题: 请问如何判断优化完的二聚体分子结构合不合理? [打印本页]

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学物理不秃头    时间: 2023-11-10 22:24
标题: 请问如何判断优化完的二聚体分子结构合不合理?
老师您好 ,我最近用高斯09优化了一个二聚体分子,但优化完发现两个分子的表面变成垂直的了,请问这种结构正常吗?输入输出文件如下,用的B3lyp泛函,6-31g(d)基组。下图第一个图片是初始结构

,第二个是优化后的结构。优化过程中也没出现不收敛或者报错的情况。

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dnlx    时间: 2023-11-11 01:25
http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
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sai77    时间: 2023-11-11 11:08
没看懂哪里变垂直了,我觉得就是联芳基的sigma键旋转了,结构是合理的
你的初始结构在连接两个酯基的亚甲基那里不太合理
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wzkchem5    时间: 2023-11-13 02:42
做构象搜索了吗?
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sobereva    时间: 2023-11-14 00:00
用wB97XD
要想得到能量最低构象必须做构象搜索




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