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标题: 求助IGMH分析之后打开vmd等值面叠加之后变成黑色 [打印本页]

作者
Author:
banxia    时间: 2023-11-11 11:25
标题: 求助IGMH分析之后打开vmd等值面叠加之后变成黑色
老师们好,我用IGMH方法对一个分子可能存在相互作用的两部分分别进行了分析,这两部分相互作用的区域所选取的片段都是2个,原子序号也不重叠。分别生成对应的cub文件之后,我拖到vmd目录下,先用IGM_inter.vmd载入了第一部分,可视化之后等值面显示绿色,是我想要的。紧接着载入第二部分的IGM_inter1.vmd,此时可视化之后我这两块的等值面都变成了黑色,我不懂这是哪里出错了,还请各位老师解答。

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-11-12 03:56
如果你要同时显示A和B片段之间,以及C和D片段之间的相互作用能,Multiwfn的IGMH功能里输入序号的时候把片段1设为A+C,片段2设为B+D即可,不需要绘制两次(这里假定A和D之间、C和B之间没有明显相互作用而导致等值面出现)。
如果非得在VMD里绘制两次,需要自己改脚本,或者在VMD图形界面里手动载入和设置作图方式。Multiwfn自带的IGM_inter.vmd不考虑使用两次的情况




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