计算化学公社

标题: 激发态计算和超算CPU核数匹配求助 [打印本页]

作者
Author: Yaohui 时间: 2023-11-13 09:15
标题: 激发态计算和超算CPU核数匹配求助
大家好，想请教下我在使用课题组超算（单节点104核计算）计算一个分子的激发态时总是提交不上任务，工程师客服调试了半天最后的回复是：

“测试了下目前这个路径下的算例88到104核，均测试显示这个报错，测试用36核24核可以正常计算的”
“在测试账号测试其他例子88-104核是可以正常识别的，观察应该跟您的算例相关”

请问大家这个是什么问题呢？之前没听说过算这种任务和cpu核数有关，求指教，谢谢大家

高斯输入文件：
%mem=200GB
%nprocshared=104
%chk=TAA.chk
# b3lyp/genecp scrf=(smd,solvent=dmso) empiricaldispersion=gd3 TD(nstates=10)

TAA

2 1
x y z
x y z
x y z

C H N 0
6-311g(d,p)
****
Ru 0
SDD
****

Ru 0
SDD

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-13 16:44
其他能跑通的算例和你这个算例在分子大小、基组大小、%mem大小等方面各有什么区别？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-13 21:36
没体系具体信息没法判断，都不知道你的体系有多大规模。光凭你贴的这点信息，没法判断有什么显著问题。通常用那么多核根本没必要，60核以上并行效率就挺低了

作者
Author: Yaohui 时间: 2023-11-14 19:45

wzkchem5 发表于 2023-11-13 16:44
其他能跑通的算例和你这个算例在分子大小、基组大小、%mem大小等方面各有什么区别？

弄清楚了老师，我用的是G16A03版本，本身限制最大64核的原因报错了，跟计算任务本身没关系了，后面修改核数限制就可以了。

作者
Author: Yaohui 时间: 2023-11-14 19:49

sobereva 发表于 2023-11-13 21:36
没体系具体信息没法判断，都不知道你的体系有多大规模。光凭你贴的这点信息，没法判断有什么显著问题。通常 ...

谢谢卢老师，最终还是看到了您的blog，找到了报错是因为G16A03版本64核数的限制问题，修改脚本已经没问题了，计算核数的选择问题，我后续再思考下，谢谢老师。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)