计算化学公社

标题: 从CP2K中的的WANNIER_CUBES输出的是什么? [打印本页]

作者
Author:
赵小壮    时间: 2023-11-15 15:34
标题: 从CP2K中的的WANNIER_CUBES输出的是什么?
我在CP2K中想要输出一个电荷密度网格,要求这个电荷网格基于的基的localize方法与 计算与wannier function center的相同。我在手册中找到了这个东西
https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL/DFT/XAS/LOCALIZE/PRINT/WANNIER_CUBES.html
然而这个只说了一句介绍:
Controls the printing of the wannier functions
我不知道这个输出的具体是什么东西,然后我自己测试了一下一个纯水体系输出的wannier_cube文件,我发现格点上的值取负,再乘上格子体积dx*dy*dz后,
加和为4.1164810168439532 |e|  非零因此应该不是全电子+核的电荷密度网格,而电荷加和分配到每个水分子上又是0.几,说明也不是价电子的电荷密度网格,不然应该是8。

所以请问这个到底输出的是什么东西啊?谢谢

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-11-17 03:31
不知道你的实际目的是什么
Multiwfn基于CP2K的molden文件可以做轨道定域化得到最大定域化Wannier函数,可以给出质心位置以及cub文件

详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
http://sobereva.com/651http://bbs.keinsci.com/thread-31827-1-1.html

Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html


作者
Author:
赵小壮    时间: 2023-11-20 10:32
sobereva 发表于 2023-11-17 03:31
不知道你的实际目的是什么
Multiwfn基于CP2K的molden文件可以做轨道定域化得到最大定域化Wannier函数,可 ...

谢谢sob老师,我的目的是对比价电子密度等值面在localization之前和之后的差异,

并要求这个localization是localization wanniner function的方法

我现在有CP2K局域化之前的cube文件,记录的是价电子密度,用的命令是FORCE_EVAL/DFT/PRINT/E_DENSITY_CUBE

我现在没有的是在localization后输出的cube文件,我只找到了WANNIER_CUBES这个命令,但输出的经检验不是价电子的电荷密度网格,难道是波函数网格?

最后我理解sob老师您的回复的意思是,Multiwfn是可以基于CP2K的轨道文件做相同的localization并给出的cub文件,并且这个cub文件是价电子密度网格的文件吗(在CP2K给出的轨道文件时用的时赝势的情况下)
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-11-21 01:54
赵小壮 发表于 2023-11-20 10:32
谢谢sob老师,我的目的是对比价电子密度等值面在localization之前和之后的差异,

并要求这个localizat ...

我没用过那个,可能给你的是localization wanniner function的轨道波函数的格点数据,凭借图形判断

Multiwfn做完轨道定域化之后,内存里的轨道就变成了定域化轨道,你可以基于这些轨道计算和导出各种格点数据,比如轨道波函数值的cube、轨道概率密度的cube、特定一些轨道贡献的电子密度的cube等等,极其灵活。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3