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标题: 求助mdp文件里rvdw的数值设定的理解问题 [打印本页]

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yueguang    时间: 2023-11-19 10:52
标题: 求助mdp文件里rvdw的数值设定的理解问题
如题,如果我设置了rvdw = 0.9,我是不是可以理解为范德华力短程截断距离为0.9 nm,而长程截断距离默认为1.4 nm?放到rcoulomb的数值设定也一样吗?

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sobereva    时间: 2023-11-19 15:21
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “mdp文件里rvdw的数值设定” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
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sobereva    时间: 2023-11-19 15:22
取决于你怎么算的范德华作用,把信息交代完整,说不清楚就贴mdp
简单截断方法根本就没有所谓的长程部分计算的事
把简单截断、twin range、邻居列表距离、Ewald、PME这些概念搞清楚。北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里都详细讲了





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