计算化学公社

标题: 请教如何用materials studio构建无定形二氧化硅气凝胶模型 [打印本页]

作者
Author: 哪壶不开提哪胡 时间: 2023-11-21 14:46
标题: 请教如何用materials studio构建无定形二氧化硅气凝胶模型
我是做纳米掺杂二氧化硅气凝胶的制备，现在想通过Materials Studio研究纳米掺杂对气凝胶热稳定的影响机理。想请教如何在Materials Studio建立无定形二氧化硅的模型？是要用脚本吗？找哪里可以找到这种类似的脚本呢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-22 03:15
免费的VMD自带的插件extensions - modelling - Inorgnic Builder直接就能建特定尺寸的无定型二氧化硅

作者
Author: 永华唐 时间: 2024-12-3 23:47

sobereva 发表于 2023-11-22 03:15
免费的VMD自带的插件extensions - modelling - Inorgnic Builder直接就能建特定尺寸的无定型二氧化硅

社长你好，这个大小好像不可以调，我的vmd版本是1.9.4，您知道怎么调尺寸么？C:\Users\24299\Desktop\2024123234352.jpg

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-4 06:44

永华唐发表于 2024-12-3 23:47
社长你好，这个大小好像不可以调，我的vmd版本是1.9.4，您知道怎么调尺寸么？

把Box dimension的三个方向的倍数（仅支持整数）调得足够大再切出需要的部分。

作者
Author: 永华唐 时间: 2024-12-4 10:20

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-4 06:44
把Box dimension的三个方向的倍数（仅支持整数）调得足够大再切出需要的部分。

谢谢，

这样得到原子非常多，如果想做少量的slab非晶的，这个还有别的操作么？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-4 10:29

永华唐发表于 2024-12-4 10:20
谢谢，这样得到原子非常多，如果想做少量的slab非晶的，这个还有别的操作么？

用VMD的原子选择语句就能做到“切出需要的部分”保存，参考社长博文http://sobereva.com/504。

作者
Author: 永华唐 时间: 2024-12-4 12:45

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-4 10:29
用VMD的原子选择语句就能做到“切出需要的部分”保存，参考社长博文http://sobereva.com/504。

谢谢您，我去试试

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