计算化学公社

标题: 用gaussian优化Tb-MOF结构一直不结束问题的求助 [打印本页]

作者
Author:
尐儿1    时间: 2023-11-22 11:47
标题: 用gaussian优化Tb-MOF结构一直不结束问题的求助
各位老师好,我在优化Tb-MOF材料时出现如下的问题,体系共133个原子,运行时间结束时结果也没有报错,就停止计算了,然后使用倒数第二步优化结果继续优化,目前已经优化13天了,也没有报错但是就是不出结果。请问老师们这个现象正常吗?我应该怎么解决这个问题?输入文件如下:
%mem=120MW
%chk=C:\Users\14718\Desktop\mof\m-Asp-1.chk
# opt=cartesian b3lyp/genecp scrf=(solvent=water,read,smd)
geom=connectivity em=gd3

m-Asp-1

-1 1
Tb                 0.21070222   -0.58637439   -0.01496577
O                 -2.02718678   -0.91242039   -0.90608877
O                 -1.24676878   -2.92728739   -0.37265077
O                  0.99969422   -2.57812539    0.80483123
O                  0.11857122    1.48041561   -1.27328277
O                  2.55252822    2.45505261    0.15671923
O                  2.83461322    0.28297061   -0.25466977
C                 -2.81864978    2.69151161   -1.39050177
C                 -3.92806078    3.47918361   -1.74647377
C                 -1.64506778    3.30359661   -0.88088777
C                 -2.16468078   -2.19793839   -0.79256277
C                 -0.61922478    2.21976461   -0.49806077
C                  3.28992222    1.40310661   -0.28292077
O                  0.48311522   -1.25505439   -3.86120177
C                  1.44344122   -1.66826339   -3.03522077
C                  2.52527922   -2.31282639   -3.73875077
C                  3.28021622   -3.51023239   -2.36755677
C                  4.24754822   -4.38495539   -3.86004877
O                  5.46997022   -4.01681139   -3.61774277
O                  1.35348422   -1.46934639   -1.81566377
O                  3.72000822   -5.08660839   -4.64964977
N                  4.05982078   -2.71403761   -2.17996523
H                 -0.18525978   -0.77616739   -3.33438377
H                  3.33398222   -1.62846039   -3.96337577
H                  2.20230722   -2.84654739   -4.61050677
H                  2.60215022   -4.14485239   -2.38703877
H                  5.57389422   -3.41225439   -2.81624177
H                  5.19101478   -3.51524561   -1.15339223
H                  3.60361078   -2.14596261   -0.70726523
O                  1.06702422    0.50406661    1.76486223
O                 -0.71733078    1.98980461    0.69784523
O                 -1.74704678   -0.68603539    1.52276723
C                  0.94016622   -2.52926039    2.04567723
C                 -3.85406478    4.93630961   -1.50331877
C                 -1.56462478    4.75477161   -0.65222677
C                 -2.68216078    5.54935361   -1.00136777
C                 -4.90653378    6.03345161   -1.84121577
O                 -4.80322278    6.27930661   -3.09151577
O                 -5.63591178    6.73814661   -1.15524277
O                 -6.19799978    3.44528261   -2.65414277
C                 -5.21633478    2.64616561   -2.18611777
O                  0.66458822    4.81748261    0.25825423
C                 -0.24483878    5.48192961   -0.19497677
O                 -0.08677578    6.87371461   -0.27224577
O                 -5.40029378    1.43980061   -2.12107077
C                 -3.48907878   -2.97564339   -1.22797077
O                 -2.97248278   -2.57065239    1.64166223
C                 -2.80467678   -1.34502739    1.77688223
C                 -4.60542378   -2.18464039   -1.57078477
C                 -3.57092678   -4.42312939   -1.46347377
C                 -5.77943778   -2.79551039   -2.07138477
C                 -4.73981778   -5.04068539   -1.96745477
C                 -2.55515178   -5.48900539   -1.04630477
C                 -5.86015178   -4.25322939   -2.31146677
C                 -6.82648678   -1.69433139   -2.41411477
O                 -2.59671678   -5.77214939    0.11840123
O                 -1.76144678   -6.27996239   -1.83262677
O                 -6.71969578   -1.44884639   -3.66390077
O                 -7.55563978   -0.99083339   -1.72887777
O                 -8.11933478   -4.28153239   -3.22809377
C                 -7.13434678   -5.08186839   -2.76682777
O                 -7.31559378   -6.29024539   -2.70956777
O                  2.67498822    1.83261161    2.50590723
O                  3.39302822    0.31699361   -2.50203077
C                  4.83444522    1.74026461   -0.74856577
C                  5.67075122    2.72345561   -0.16392077
C                  5.53036922    0.90547061   -1.68262777
C                  7.10892822    2.80999261   -0.42389877
C                  6.95965022    0.98719661   -1.94746177
C                  4.58645722    0.21269361   -2.63054777
C                  7.80999722    1.96641061   -1.35350577
C                  7.98433322    3.55620061    0.57855023
O                  9.27594022    3.41865461    0.39354523
O                  7.52850222    3.99831761    1.62076123
O                  5.13710522   -0.30225039   -3.79160177
C                  9.35014222    2.27840161   -1.92104077
O                 10.02290022    1.22275461   -2.33840877
O                  9.83907522    3.42235061   -1.89134377
C                  2.20239722    0.58171261    2.20804323
O                 -0.05269978   -2.89776439    2.70415923
C                  2.35636222   -2.07874739    2.50893023
C                  2.97347422   -0.73735839    2.49035923
C                  4.32123622   -0.60826039    2.89275923
C                  3.10372122   -3.22831039    2.86992123
C                  5.05243722   -1.75151739    3.26635623
C                  4.44386022   -3.09936139    3.28266223
C                  6.46746622   -1.33640739    3.70175923
O                  6.45563622   -1.31215839    4.97541723
O                  6.36242322   -4.32014839    4.07878623
C                  5.25989622   -4.42121039    3.58569123
O                  7.46735622   -0.95688539    3.08651623
O                  4.74711222   -5.69537939    3.31948523
C                 -4.08406278   -0.40580939    2.37698623
C                 -5.13156678   -0.94295139    3.20872223
C                 -4.35948278    0.92471361    1.96401423
C                 -6.37524078   -0.24031839    3.51813023
C                 -4.67515978   -2.14509739    3.99015423
C                 -5.59545178    1.63691561    2.27897423
C                 -6.64759778    1.09479861    3.10339123
O                 -3.55203078   -2.57617239    3.86501823
O                 -5.42453178   -2.48072139    5.11429123
C                 -5.98031678    2.81287461    1.42714923
O                 -7.21901578    3.23515061    1.66415523
O                 -5.35047578    3.15476261    0.44129023
C                 -7.69335300    2.21392000    3.74472900
O                 -8.85528800    1.56156900    4.07155000
O                 -7.60248200    3.41226000    3.90551200
H                  0.31268922    7.13671661   -1.13263577
H                 -4.00794478    5.79964561   -3.37540477
H                 -6.03521978    3.60131061   -3.60159877
H                 -7.66516078    3.44769961    0.83920223
H                 -9.17000700    1.07574400    3.28070100
H                 -6.07286378   -3.19131139    4.97750723
H                 -7.13645678   -0.74292839    4.12538823
H                 -3.59519478    1.42734461    1.35726623
H                 -4.77513478   -6.14454039   -2.09334077
H                 -4.56959278   -1.07952539   -1.44455877
H                 -7.95979178   -4.11932339   -4.17343377
H                 -5.92567278   -1.92930239   -3.94637977
H                 -1.66319378   -5.94016539   -2.73332477
H                 -2.64896878    6.65327561   -0.87967577
H                 -2.85541478    1.58563661   -1.50862277
H                  7.41532922    0.27844161   -2.64642677
H                  5.21614822    3.43337861    0.53559323
H                  9.65574500    3.58378900   -0.57425600
H                 10.41425122    1.31314061   -3.23736077
H                  5.18376522    0.45524461   -4.41904177
H                  4.99475922   -5.99668739    2.41636323
H                  7.39131322   -1.17046639    5.19564523
H                  2.60969122   -4.22403439    2.84093123
H                  4.80667322    0.38973161    2.92263323
H                  2.51081622    3.15777561   -0.52047277
H                  3.10252522    2.28179661    1.72775223

1 4 1.0 20 1.0 30 1.0 31 1.0 5 1.0 7 1.0 2 1.0 3 1.0 32 1.0
2 11 1.0
3 11 2.0
4 33 1.0
5 12 1.0
6 13 1.0 132 1.0
7 13 2.0
8 9 1.5 10 1.5 122 1.0
9 34 1.0 41 1.0
10 12 1.0 35 1.0
11 46 1.0
12 31 2.0
13 65 1.0
14 15 1.0 23 1.0
15 16 1.0 20 2.0
16 24 1.0 25 1.0 17 1.0
17 22 1.0 26 1.0 18 1.0
18 19 1.0 21 2.0
19 27 1.0
20
21
22 29 1.0 28 1.0
23
24
25
26
27
28
29
30 79 2.0
31
32 48 1.0
33 80 2.0 81 1.0
34 36 1.5 37 1.0
35 36 1.5 43 1.0
36 121 1.0
37 38 2.0 39 2.0
38 109 1.0
39
40 41 1.0 110 1.0
41 45 2.0
42 43 2.0
43 44 1.0
44 108 1.0
45
46 49 1.5 50 1.0
47 48 2.0
48 93 1.0
49 51 1.5 117 1.0
50 52 1.5 53 1.0
51 54 1.0 55 1.0
52 54 1.5 116 1.0
53 56 2.0 57 1.0
54 61 1.0
55 58 2.0 59 2.0
56
57 120 1.0
58 119 1.0
59
60 61 1.0 118 1.0
61 62 2.0
62
63 79 1.0 133 1.0
64 70 2.0
65 66 1.5 67 1.5
66 68 1.0 124 1.0
67 69 1.0 70 1.0
68 71 1.5 72 1.0
69 71 1.5 123 1.0
70 75 1.0
71 76 1.0
72 73 1.0 74 2.0
73
74
75 127 1.0
76 77 1.0 78 2.0
77 126 1.0
78
79 82 1.0
80
81 82 1.0 84 1.5
82 83 1.5
83 85 1.5 131 1.0
84 86 1.5 130 1.0
85 86 1.0 87 1.0
86 90 1.0
87 88 1.0 91 2.0
88 129 1.0
89 90 2.0
90 92 1.0
91
92 128 1.0
93 94 1.5 95 1.5
94 96 1.0 97 1.0
95 98 1.0 115 1.0
96 99 1.5 114 1.0
97 100 2.0 101 1.0
98 99 1.5 102 1.0
99 105 1.0
100
101 113 1.0
102 103 1.5 104 2.0
103 111 1.0
104
105 106 1.0 107 2.0
106 112 1.0
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133

C H O N 0
6-31g*
****
Tb 0
MWB54
****

Tb 0
MWB54

(, 下载次数 Times of downloads: 5)



作者
Author:
北大-陶豫    时间: 2023-11-22 16:15
这么大的玩意,还在Windows电脑上跑?趁早搞个Linux服务器,用Linux高斯,多核计算,才是正途。
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2023-11-22 16:52
你需要的不是解决这个(些)问题,而是换成CP2K/QE/VASP等擅长周期性计算的第一性原理程序跑
作者
Author:
尐儿1    时间: 2023-11-22 18:11
北大-陶豫 发表于 2023-11-22 16:15
这么大的玩意,还在Windows电脑上跑?趁早搞个Linux服务器,用Linux高斯,多核计算,才是正途。

嗯嗯,好的谢谢老师的回复。我用的就是Linux服务器,上传的文件是本地计算机里的,可能造成了误导。
作者
Author:
尐儿1    时间: 2023-11-22 18:15
zjxitcc 发表于 2023-11-22 16:52
你需要的不是解决这个(些)问题,而是换成CP2K/QE/VASP等擅长周期性计算的第一性原理程序跑

谢谢老师的回复,我尝试一下这些程序。但是如果我继续用高斯进行计算的话会出结果吗?
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2023-11-22 19:21
尐儿1 发表于 2023-11-22 18:15
谢谢老师的回复,我尝试一下这些程序。但是如果我继续用高斯进行计算的话会出结果吗?

可能可以,但不是目前这么算。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3