分子动力学模拟方法探究在室温条件下一种多元醇和混合多元醇水溶液中多元醇的聚集行为 - 计算化学公社

运用分子动力学模拟方法（使用Gromacs 2018.2程序，建立不同多元醇在OPLSAA力场下的参数，构建多元醇模型，在多元醇醇溶液体系中填充TIP3P类型的水分子，模拟温度为298.15 K，压力为1 atm，温度耦合使用V-rescale方法，压力耦合使用Parrinello-Rahman方法等）探究一种多元醇和混合多元醇水溶液中多元醇的聚集行为，考察不同多元醇中的一种多元醇的聚集倾向和混合多元醇的聚集情况；使用约化密度梯度法(RDG)定性分析多元醇二聚体之间的相互作用，用平均约化密度梯度法(aRDG)定性分析多元醇与水分子的相互作用；研究多元醇单分子和聚集体在水中的形态及其尺寸，分析多元醇在水中聚集趋势不同的原因。