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标题: 如何改变两个基团的折叠角度 [打印本页]

作者
Author: sxy66 时间: 2023-11-22 17:32
标题: 如何改变两个基团的折叠角度
各位老师好，我想把这个分子结构折叠成不同的角度去测SOC的大小，但是用高斯试过了，没办法让两个苯环跟着一起改变角度达到折叠目的，我应该如何操作呢 (, 下载次数 Times of downloads: 0) 附件里，是我的分子结构
(, 下载次数 Times of downloads: 10)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-22 17:38
用GIC方法（http://sobereva.com/404）。由立体几何知识不难确定具体需要定义什么样的GIC才能实现你的目的

作者
Author: sxy66 时间: 2023-12-7 10:28
本帖最后由 sxy66 于 2023-12-7 10:29 编辑

老师，高斯好像没办法实现这个分子的两个平面之间角度的改变，我用高斯即使冻结一些原子，但他的角度的改变方向是附件里图一的样子，但我想让分子实现的是附件里图二的效果 (, 下载次数 Times of downloads: 9) (, 下载次数 Times of downloads: 9)

作者
Author: pal 时间: 2023-12-7 11:28

sxy66 发表于 2023-12-7 10:28
老师，高斯好像没办法实现这个分子的两个平面之间角度的改变，我用高斯即使冻结一些原子，但他的角度的改变 ...

看这示意图的样子就是两边以中间的两个原子作为旋转轴来旋转，根据旋转轴确定旋转矩阵不就好了

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