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标题: dalton计算求助 [打印本页]

作者
Author: wyf 时间: 2016-9-27 14:33
标题: dalton计算求助
本帖最后由 wyf 于 2016-9-27 14:48 编辑

   各位大神好！             如题，由于最近在做TADF分子的相关研究，学习了道尔顿的使用，想用它来计算S1态与T1态之间的自旋轨道耦合常数，但是有几个分子的计算总是报错，我也搜过一些解决方案并重复过计算（例如：删掉缓存文件），但是没能够解决我目前遇到的问题。
   还有一个问题是，dalton一般用于计算什么类型的分子呢？我再google上搜过，似乎并没有用dalton来计算TADF分子的相关文献，是否为dalton程序不能够计算TADF分子呢？
   还望诸位大神不吝赐教，万分感谢！
   附件里面为其中一个出错分子的mol，dal文件以及out文件。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-9-27 15:34
dalton应该能够计算这个旋轨耦合。我记得网上有可行的例子。然后我看了这个.dal和.mol文件，按说没有问题的。我隐约记得网上说的是，修改了dalton源程序。
然后你把这一行添加到你的文件脚本中：
dalton -mb 3000 -N $NPROCS -t /tmp/$PBS_JOBID 1.dal 1.mol你试试，不一定可行哈。
PS：我见过ADF也计算了旋轨耦合，同时我咨询一下，你计算这个soc的时候，基于谁的构型？S0.S1.还是T1？谢谢

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-9-27 15:38
本帖最后由小范范1989 于 2016-9-27 15:39 编辑

同时，借助您的帖子，我咨询一个问题，希望高手指点一下。
就是.dal文件中：
.PROPRT
X1MNF-SO
.PROPRT
Y1MNF-SO
.PROPRT
Z1MNF-SO

计算之后，我们得到的有
@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label, symmetry, spin:    X1MNF-SO 1 1
@ B excited state no., symmetry, spin:          1 1 0
@ C excited state no., symmetry, spin:          2 1 1

@ B and C excitation energies, moment: 0.09025588 0.08802946 0.00000007

@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label, symmetry, spin:    Y1MNF-SO 1 1
@ B excited state no., symmetry, spin:          1 1 0
@ C excited state no., symmetry, spin:          2 1 1

@ B and C excitation energies, moment: 0.09025588 0.08802946 0.00000005

@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label, symmetry, spin:    Z1MNF-SO 1 1
@ B excited state no., symmetry, spin:          1 1 0
@ C excited state no., symmetry, spin:          2 1 1

@ B and C excitation energies, moment: 0.09025588 0.08802946  -0.00000003
上面的数据，最后选取数值的时候：
1：三个方向，这个最后是平方加和，再开方？把X1MNF-SO，Y1MNF-SO,Z1MNF-SO理解为三个方向？
2：还是说：平方加和，除以3.再开方？把X1MNF-SO，Y1MNF-SO,Z1MNF-SO理解为是三重态的三个简并态？
以上两种方案，采用哪种呢？
谢谢指点。

作者
Author: wyf 时间: 2016-9-27 17:05
本帖最后由 wyf 于 2016-9-27 17:09 编辑

小范范1989 发表于 2016-9-27 15:34
dalton应该能够计算这个旋轨耦合。我记得网上有可行的例子。然后我看了这个.dal和.mol文件，按说没有问题的 ...

在计算SOC时，我是基于S0的结构进行计算的。在安装道尔顿的时候，我已经将源程序symtra.F中parameter中的参数均修改为原来的10倍，同时也将投递脚本中的/opt/DALTON-Source/build/dalton -mb 1000 -t /tmp中的mb修改为5000，但是并没有解决这个问题，所以才会求助于各位大神，除了内存的原因是否存在其他的原因呢？还望大神能够指点一下，谢谢。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-9-27 19:25

wyf 发表于 2016-9-27 17:05
在计算SOC时，我是基于S0的结构进行计算的。在安装道尔顿的时候，我已经将源程序symtra.F中parameter中的 ...

嘿嘿，师妹，原来是你。

作者
Author: ZHANGZY 时间: 2017-5-10 21:03
小范范1989,
您的问题解决了吗？我也遇到同样问题，解决不了，盼望得到您的帮助，多谢

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