计算化学公社

标题: 请教高斯重复文献中酞菁钴不同状态相对能量问题 [打印本页]

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zhangxy    时间: 2023-11-23 12:15
标题: 请教高斯重复文献中酞菁钴不同状态相对能量问题
各位老师好,最近在学习并重复文献中的计算结果,文献使用gaussian16程序,泛函为PBE0-GD3BJ,基组为def2-SVP,使用隐式溶剂模型(water),如图1;文献以电中性的CoPc的电子能量为基准(0 eV),计算了其余几种结构的相对能量,计算结果与方法如图2。文献为https://doi.org/10.1038/s41467-023-39153-6

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我以相同方法计算得到的结果如图片3所示,其中CoPc、H2CoPc、H4CoPc优化了自旋多重度为2和4的结构并选能量最小值填入表格,CoPc-、H1CoPc、H3CoPc在稳定的波函数下优化了自旋多重度为1和3的构型并选能量最小值填入表格(泛函为upbe0),问题如下:


1、以电中性酞菁钴分子CoPc为基准(0 eV),计算得到一个电子的结构(CoPc-)的相对能量能否看作是电子亲合能?文献中计算结果为-0.147 eV,这个值是否合理?我以CoPc-的电子能量减去CoPc的电子能量计算为-3.306 eV,是否合理?
2、所计算的H1CoPc—H4CoPc的相对能量值和能量变化趋势也都与文献报道不同,但又不知道错在哪里,计算文件见附件,请老师指点。

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wzkchem5    时间: 2023-11-23 17:06
1. 可以,但需要注意电势零点问题,量化软件默认以真空能级为电势零点,但文献未必以真空能级为电势零点,可能是以另外某个电势为电势零点的
2. 注意自旋多重度正确、波函数稳定,不足以保证波函数正确。需要检查自旋密度、前线轨道等,确定波函数满足化学常识,结果才可以用
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zhangxy    时间: 2023-11-24 09:56
wzkchem5 发表于 2023-11-23 17:06
1. 可以,但需要注意电势零点问题,量化软件默认以真空能级为电势零点,但文献未必以真空能级为电势零点, ...

谢谢老师回复。
关于第一点,文献中是以CoPc为电势零点,计算其他结构相对CoPc的能量差值,我重复的结果与文献结果相差甚远,您觉得问题可能出在哪里?
关于第二点,我目前确实只考察了波函数稳定性和自旋多重度,其余问题我检查后再向您请教。
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wzkchem5    时间: 2023-11-24 19:08
zhangxy 发表于 2023-11-24 02:56
谢谢老师回复。
关于第一点,文献中是以CoPc为电势零点,计算其他结构相对CoPc的能量差值,我重复的结果 ...

注意区分能量零点和电势零点。文献的能量零点是CoPc,电势零点不是。
常用的电势零点包括:真空能级、标准氢电极、实验上实际用的电势,等等




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