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标题: 请教如何计算A分子的碳原子与B分子的氧原子的径向分布函数 [打印本页]

作者
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ngaoo    时间: 2023-11-25 22:13
标题: 请教如何计算A分子的碳原子与B分子的氧原子的径向分布函数
老师,我的体系里面有50个A分子和50个B分子,我想计算的是A分子的碳原子与B分子的氧原子的径向分布函数,分组的时候将50个分子(所有的碳)分在一组,剩下的50个B原子的氧原子分为一组,这样计算对吗?还请问老师,怎么把50个A分子的C原子全部分在一组?





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sobereva    时间: 2023-11-26 03:02


用gmx make_ndx创建索引文件,利用里面的恰当的命令选择(结合残基名、原子名)
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ngaoo    时间: 2023-11-27 10:51
sobereva 发表于 2023-11-26 03:02


用gmx make_ndx创建索引文件,利用里面的恰当的命令选择(结合残基名、原子名)

谢谢老师的回答




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