计算化学公社

标题: 求助Gromacs分析PC1和PC2作二维图 [打印本页]

作者
Author: danyunlee 时间: 2023-11-26 03:30
标题: 求助Gromacs分析PC1和PC2作二维图
请问各位大佬，gromacs分析得到PC1和PC2后这个图是怎么做出来的啊，不知道用的什么软件。

求大佬赐教下步骤，，好像不能一个当成x一个当成y画出来。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-26 03:57
轨迹里每一帧在PC1和PC2上都有对应的投影值，绘制成折线图就完了。下文提到了

浅谈PCA与g_covar+g_anaeig+ddtdp+sigmaplot做自由能面图的方法
http://sobereva.com/73

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