计算化学公社

标题: 求助，vasp跑AIMD如何体现水环境？ [打印本页]

作者
Author: XIEH 时间: 2023-11-26 13:53
标题: 求助，vasp跑AIMD如何体现水环境？
小白求助，我现在需要对V2C在水中的氧化降解生成团簇进行AIMD模拟，现在有包含144个原子的CONTCAR，是直接将其复制成POSCAR接着在INCAR设置体现水环境的参数吗？
还是我需要在POSCAR中体现出水环境？
新手蒙昧，请大佬点拨一下，万分感谢！

作者
Author: 含光君 时间: 2023-11-26 15:19
根据自己的实际计算需求选择使用显式溶剂模型还是隐式溶剂模型。
前者直接在盒子中加上水分子即可，后者编译vaspsol在INCAR中加上ISOL参数。

作者
Author: XIEH 时间: 2023-11-27 09:50

含光君发表于 2023-11-26 15:19
根据自己的实际计算需求选择使用显式溶剂模型还是隐式溶剂模型。
前者直接在盒子中加上水分子即可，后者编 ...

首先感谢您的回复，
但是为什么我在vasp手册中没有搜到ISOL这个参数呢？
也去vasp wiki 搜了一下，也没有相关的介绍。
能麻烦您给我讲解一下这个参数以及如何设置吗？

作者
Author: 含光君 时间: 2023-11-27 09:53

XIEH 发表于 2023-11-27 09:50
首先感谢您的回复，
但是为什么我在vasp手册中没有搜到ISOL这个参数呢？
也去vasp wiki 搜了一下，也没 ...

详见 https://github.com/henniggroup/VASPsol
需在编译vasp同时编译好vaspsol才能使用

作者
Author: yxzinc 时间: 2023-11-27 10:00
AIMD模拟一般都是显式水，直接根据盒子大小加入一定数量的水分子即可。但是你这个是没加水就144个原子？那估计很难跑动，可能需要考虑用cp2k

作者
Author: XIEH 时间: 2023-11-27 10:07

含光君发表于 2023-11-27 09:53
详见 https://github.com/henniggroup/VASPsol
需在编译vasp同时编译好vaspsol才能使用

感谢

作者
Author: XIEH 时间: 2023-11-28 17:01

yxzinc 发表于 2023-11-27 10:00
AIMD模拟一般都是显式水，直接根据盒子大小加入一定数量的水分子即可。但是你这个是没加水就144个原子？那 ...

感谢您的回复，目前刚接触，都学一下

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