计算化学公社

标题: 请教大家,吸附位点是自己试出来的还是把原子随便放在一个位置上自己优化出来的? [打印本页]

作者
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zhaojingjing    时间: 2023-12-8 17:19
标题: 请教大家,吸附位点是自己试出来的还是把原子随便放在一个位置上自己优化出来的?
在计算吸附时,我请教组里的师姐吸附位点是自己一个个算之后找出来的吗?她说是把slab的最上面三层放开,把吸附原子放开,在优化的过程吸附原子会自己找到能量最低的点,但是我看文献,基本上每一篇都测试了各种高对称吸附点。所以最佳吸附位点要不要测试呢?谢谢大家!

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-12-8 18:18
可以自己手动摆各种可能有意义的初始结构(考虑各种可能的吸附位点、各种朝向),或者跑吸附体系的动力学并每隔一定时间取结构做几何优化,或者用dockonsurf结合CP2K自动产生各种表面吸附结构。




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