计算化学公社

标题: 含三种分子的结构怎么计算其中两种分子间相互作用能 [打印本页]

作者
Author: loovfnd 时间: 2023-11-28 19:35
标题: 含三种分子的结构怎么计算其中两种分子间相互作用能
本帖最后由 loovfnd 于 2023-11-28 19:39 编辑

在实际的科研工作中，遇到了下面这种情况，比如ABC三种分子按照这种形式排布（非线性的），怎么计算AB之间或者BC之间的相互作用能的大小（H键或者存在色散作用）。或者怎么描述之间相互作用。

(, 下载次数 Times of downloads: 30)

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-29 03:05
参考北京科音基础（中级）量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）讲弱相互作用计算部分的ppt

(, 下载次数 Times of downloads: 32)

“描述之间相互作用” 太含糊，描述方式多了去了，诸如IGMH就非常适合直观展现指定片段间的相互作用
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）

作者
Author: loovfnd 时间: 2023-11-29 10:02

sobereva 发表于 2023-11-29 03:05
参考北京科音基础（中级）量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）讲弱相互 ...

请教社长，这个ΔE（A……C）=EAC-EA-EC是单独优化AC结构后，用CP方法获得吗？还是用ABC优化好的结构中把B去除后用CP计算得到的。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-30 10:05

loovfnd 发表于 2023-11-29 10:02
请教社长，这个ΔE（A……C）=EAC-EA-EC是单独优化AC结构后，用CP方法获得吗？还是用ABC优化好的结构中 ...

就是算个相互作用能，是否以CP方式考虑BSSE效应不是当前问题的关键
不要把“CP方法”当做算相互作用能的代名词，看下文
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

作者
Author: loovfnd 时间: 2023-11-30 14:37

sobereva 发表于 2023-11-30 10:05
就是算个相互作用能，是否以CP方式考虑BSSE效应不是当前问题的关键
不要把“CP方法”当做算相互作用能的 ...

会注意的，社长。涉及三个组分，考虑变形能，计算解离能，则用AC优化的结构。是不是可以这么理解。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-1 05:09

loovfnd 发表于 2023-11-30 14:37
会注意的，社长。涉及三个组分，考虑变形能，计算解离能，则用AC优化的结构。是不是可以这么理解。

ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构，不优化单体或二聚体

作者
Author: loovfnd 时间: 2023-12-1 22:34

sobereva 发表于 2023-12-1 05:09
ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构，不优化单体或二聚体

需要算三次相互作用能，分别得到各个校正后的能量。是这样吧，社长

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-2 11:10

loovfnd 发表于 2023-12-1 22:34
需要算三次相互作用能，分别得到各个校正后的能量。是这样吧，社长

ppt里诸如E_BC是指B-C复合物的能量，不是B-C相互作用能

作者
Author: loovfnd 时间: 2023-12-2 18:16

sobereva 发表于 2023-12-2 11:10
ppt里诸如E_BC是指B-C复合物的能量，不是B-C相互作用能

明白了，社长，感谢指导。

作者
Author: 一条君 时间: 2024-6-4 22:14

sobereva 发表于 2023-11-29 03:05
参考北京科音基础（中级）量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）讲弱相互 ...

请问老师ppt里的方法能计算在C存在下，A-B间结合的吉布斯自由能变吗？
（6楼里解答的是【ppt里计算ΔE用的始终是整个复合物结构，不优化单体或二聚体】，由此是否得出不能得到吉布斯自由能变？）

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-5 03:16

一条君发表于 2024-6-4 22:14
请问老师ppt里的方法能计算在C存在下，A-B间结合的吉布斯自由能变吗？
（6楼里解答的是【ppt里计算ΔE用 ...

不能

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)