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标题: 能量平衡时，itp文件中氧原子识别出错 [打印本页]

作者
Author: Anbling 时间: 2023-11-29 22:46
标题: 能量平衡时，itp文件中氧原子识别出错
各位大佬好，我在对模型平衡时，一直报错。命令行为gmx grompp -f tip4p_1_en.mdp -c tip4p_1_add.pdb -p topol.top -o em.tpr -maxwarn 2。
报错为：
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但是自己检查了.itp文件、.pdb文件，如下图所示。不清楚为何会报找不到OW的错误，请各位大佬指教！
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另附拓扑文件的截图，是否会与拓扑文件有关。
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作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-1 06:08
看清楚板块再发贴，gromacs问题发到量子化学版做什么？这次给你移动了，下次乱找地方发帖直接删帖+扣分处理

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-1 06:10
OPLS-AA目录下的ffnonbonded.itp里的[atomtypes]根本没有OW原子类型的定义
自己补充TIP4P-ice需要用到的原子类型定义

作者
Author: Anbling 时间: 2023-12-4 15:17

sobereva 发表于 2023-12-1 06:08
看清楚板块再发贴，gromacs问题发到量子化学版做什么？这次给你移动了，下次乱找地方发帖直接删帖+扣分处理

好的sob老师，抱歉。

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