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标题: 求助：对单偶氮分散染料进行结构优化与激发态计算前需要进行构象搜索吗？ [打印本页]
作者
Author: xiaokexxk    时间: 2023-11-30 15:04
标题: 求助：对单偶氮分散染料进行结构优化与激发态计算前需要进行构象搜索吗？
本帖最后由 xiaokexxk 于 2023-11-30 15:04 编辑

各位老师好，目前我做了以下四种结构染料在CAM-B3LYP/ 6-311G**和B3LYP/6-311G**，PCM溶剂模型（DMF溶剂），使用D3(BJ)色散校正条件下的结构优化与激发态计算，得到它们的UV-Vis光谱数据，使用不同的泛函得到的结果与实验室测得的数据相差比较大。

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染料
λexp（nm）
λcal（nm）
CAM-B3LYP/ 6-311G**
B3LYP/6-311G**
  
C.I.Disperse Orange44
  		  
425
  		  
444.72
  		  
501.92
  
  
C.I.Disperse Orange25
  		  
479
  		  
441.12
  		  
505.29
  
  
C.I.Disperse Red50
  		  
498
  		  
459.96
  		  
519.83
  
C.I.Disperse Red73
437
470.2
519.91

看到有论文在结构优化之前进行了构象搜索，并且计算染料优化后结构的Boltzmann分布比例，然后对构象计算激发态，最后绘制FWHM为0.45eV下该染料的构象平均光谱。但看其最大吸收波长数据与实验所测结果还是存在一些差距。

染料
λexp（nm）
λcal（nm）
6-311G**
TZVP
B3LYP
PBE0
CAM-B3LYP
B3LYP
PBE0
CAM-B3LYP
  
DB183
  		  
592
  		  
553.0
  		  
538.3
  		  
510.3
  		  
566.5
  		  
548.6
  		  
519.4
  
  
DB60
  		  
672
  		  
678.0
  		  
658.9
  		  
604.3
  		  
673.4
  		  
654.6
  		  
600.5
  
  
DB291-1
  		  
598
  		  
594.1
  		  
576.3
  		  
533.9
  		  
607.7
  		  
587.9
  		  
544.1
  
  
DB79
  		  
583
  		  
604.5
  		  
577.8
  		  
504.2
  		  
622.2
  		  
591.0
  		  
512.7
  
  
DB56
  		  
621
  		  
568.6
  		  
551.7
  		  
498.8
  		  
565.1
  		  
548.5
  		  
496.4
  
  
DY23
  		  
389
  		  
459.2
  		  
442.2
  		  
396.8
  		  
462.6
  		  
444.4
  		  
399.7
  
  
DY42
  		  
419
  		  
438.0
  		  
417.1
  		  
369.4
  		  
450.2
  		  
426.8
  		  
379.1
  
  
DY114
  		  
417
  		  
394.0
  		  
382.8
  		  
353.7
  		  
394.9
  		  
383.3
  		  
354.9
  
  
DY211
  		  
436
  		  
414.0
  		  
393.6
  		  
347.8
  		  
427.7
  		  
399.7
  		  
351.2
  
  
DV26
  		  
549
  		  
518.0
  		  
498.3
  		  
451.1
  		  
534.2
  		  
520.7
  		  
480.3
  
  
DR167
  		  
521
  		  
489.1
  		  
474.7
  		  
430.8
  		  
533.0
  		  
509.2
  		  
457.9
  
  
DR60
  		  
520
  		  
528.2
  		  
495.5
  		  
403.5
  		  
487.9
  		  
473.6
  		  
430.4
  
  
DO73
  		  
466
  		  
520.7
  		  
488.4
  		  
393.9
  		  
533.3
  		  
504.0
  		  
428.9
  
  
DO30
  		  
423
  		  
515.6
  		  
492.7
  		  
431.2
  		  
537.1
  		  
502.2
  		  
399.1
  
  
DO44
  		  
425
  		  
510.2
  		  
486.4
  		  
422.7
  		  
532.5
  		  
505.0
  		  
439.6
  
DO31
438
515.6
492.7
431.2
528.0
499.6
431.9


请问各位老师，①构象搜索有必要做吗？②要做的话能与实验测得数据更加接近吗？③是否可以通过改变泛函与基组使计算结果更加准确？④如果要进行构象搜索有什么比较简便的方法？（我现在尝试使用gaussian里的GMMX进行构象搜索一种染料得到154种构象）





作者
Author: sobereva    时间: 2023-12-1 05:38
1 最好做构象搜索

2 未必，影响误差的来源很多，要明白误差巧合性抵消是什么意思

3 可能可以
更好的可尝试TD-双杂化，或DLPNO-STEOM-CCSD，基组提升到ma-def2-TZVP。还可以用特定态溶剂模型等
硝基应当带弥散

要对计算级别的误差范围心里有数，别盲目追求与实验的极致吻合而各种浪费时间去凑。中等波长范围TDDFT算到二三十nm误差就已经很不错了。

gentor+molclus是此体系构象搜索的首选。难以置信还有人用GMMX
Molclus主页
http://www.keinsci.com/research/molclus.html
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html




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