计算化学公社

标题: 分子半径的计算,缺少手册上的指令了 [打印本页]

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BewhY    时间: 2023-12-1 16:47
标题: 分子半径的计算,缺少手册上的指令了
我们需要获得能够扩住这个分子范德华表面(这里用电子密度0.001等值面来定义)的最小盒子尺寸。这可以通过Multiwfn来做。先用Gaussian计算出这个分子的wfn或fch文件,载入进Multiwfn后选
12  //定量分子表面分析
2  //修改被映射的函数
-1  //改为用户自动以函数(计算没有耗时)
0  //开始分析
然后从屏幕的输出中能够找到ρ=0.001定义的分子表面的顶点的X、Y、Z方向上的最小和最大值:
Min-X:     -2.0419  Max-X:    2.0420 Angstrom
Min-Y:     -5.9055  Max-Y:    5.9055 Angstrom
Min-Z:     -3.7916  Max-Z:    3.7916 Angstrom
比如盒子的Z长度就是3.7916*2=7.58埃。


以上为计算步骤,但是我计算过程中,从步骤12直接到0了,没有中间的步骤2和-1,一开始是有2和-1的选项,后面又没有了。想请教一下怎么解决?

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sobereva    时间: 2023-12-2 12:25
截图说明

引用我博文原话的时候把出处注明,别让别人以为是你写的东西
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BewhY    时间: 2023-12-2 16:40
sobereva 发表于 2023-12-2 12:25
截图说明

引用我博文原话的时候把出处注明,别让别人以为是你写的东西

好的 卢博士。下次注意
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BewhY    时间: 2023-12-2 16:45
sobereva 发表于 2023-12-2 12:25
截图说明

引用我博文原话的时候把出处注明,别让别人以为是你写的东西

截图如下,步骤12以后的步骤2不对

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sobereva    时间: 2023-12-3 00:52
BewhY 发表于 2023-12-2 16:45
截图如下,步骤12以后的步骤2不对

怎么不对?屏幕上有选项2,按照我博文说的指令,选它就完了




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