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标题: 是否存在结构差异很小且找不到过渡态的异构体 [打印本页]

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xujian    时间: 2016-9-29 18:49
标题: 是否存在结构差异很小且找不到过渡态的异构体
在计算OSNC(O)N异构体的时候,发现了两个结构非常类似,几乎只有一个二面角存在一些差异的异构体,如附件1和2,找他们之间的过渡态(虚频很小,只有27.84)走IRC却得到如下的IRC图,想请问老师们,是否可能这种结构很类似的异构体之间不存在过渡态。 (, 下载次数 Times of downloads: 29)
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liyuanhe211    时间: 2016-9-29 19:16
存在这样的情况。但你的这个IRC不正常是因为TS定位精度不够所致
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xujian    时间: 2016-9-29 19:19
liyuanhe211 发表于 2016-9-29 19:16
存在这样的情况。但你的这个IRC不正常是因为TS定位精度不够所致

但是两者之间差异太小了,找来找去过渡态都是这个,所以很无奈,谢谢您!
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liyuanhe211    时间: 2016-9-29 20:06
xujian 发表于 2016-9-29 19:19
但是两者之间差异太小了,找来找去过渡态都是这个,所以很无奈,谢谢您!

不是过渡态不对,是不够精确
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xujian    时间: 2016-9-29 21:03
liyuanhe211 发表于 2016-9-29 20:06
不是过渡态不对,是不够精确

您的意思我理解成过渡态是正确的,走IRC的时候关键词可以用calcall,并且加大每步的间隔试一下,不知道是不是这个意思,麻烦您了
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lijiayisjtu    时间: 2018-3-3 11:20
xujian 发表于 2016-9-29 21:03
您的意思我理解成过渡态是正确的,走IRC的时候关键词可以用calcall,并且加大每步的间隔试一下,不知道是 ...

意思是不是这样,过渡态的结构基本正确,但虚频还不够大,加上calcall后可得到精确的TS结构

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xujian    时间: 2018-3-3 14:18
lijiayisjtu 发表于 2018-3-3 11:20
意思是不是这样,过渡态的结构基本正确,但虚频还不够大,加上calcall后可得到精确的TS结构

之后用更高的基组计算后,有一个异构体是不存在的,猜测也有可能是基组小引起的误差
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lijiayisjtu    时间: 2018-3-4 09:35
xujian 发表于 2018-3-3 14:18
之后用更高的基组计算后,有一个异构体是不存在的,猜测也有可能是基组小引起的误差

谢谢你的回答~





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