计算化学公社

标题: 在VMD中扩胞后如何保存扩胞后的模型 [打印本页]

作者
Author: 姜酱将 时间: 2023-12-2 12:22
标题: 在VMD中扩胞后如何保存扩胞后的模型
如题，我在VMD中沿X向扩胞后，尝试去保存扩胞后的模型，但无论是通过建立新的rep，还是其他的一些尝试，都未能成功保存。请教各位VMD是否能够保存扩胞后的文件？请教一下做法，谢谢各位

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-2 12:30
显示晶胞的周期镜像和做扩胞完全是两码事

Multiwfn、gmx genconf等都可以扩胞。如果必须用VMD实现，看北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

作者
Author: 姜酱将 时间: 2023-12-2 17:01

sobereva 发表于 2023-12-2 12:30
显示晶胞的周期镜像和做扩胞完全是两码事

Multiwfn、gmx genconf等都可以扩胞。如果必须用VMD实现，看北 ...

好的，谢谢社长

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