计算化学公社

标题: 频率分析断掉，找到rwf文件，如何知道xx.rwf对应哪个任务？ [打印本页]

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-29 21:17
标题: 频率分析断掉，找到rwf文件，如何知道xx.rwf对应哪个任务？
求问，LZ用服务器计算频率分析，断掉，之后在scratch文件夹中找到rwf文件，但在该文件下有很多rwf文件，求问如何找到我任务的rwf文件？rwf文件名是否有具体含义？

作者
Author: believeht 时间: 2016-9-29 21:32
打开.out文件，第4-6行应该为下列内容：
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -scrdir=/root/
Entering Link 1 = /home/ren/g09/l1.exe PID= 950.
rwf文件应该为“Gau-950.rwf”，rwf文件名中的数字应该与PID的数字对应。

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-29 21:43

believeht 发表于 2016-9-29 21:32
打开.out文件，第4-6行应该为下列内容：
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -s ...

非常感谢您，已解决。感恩~~

作者
Author: 三石草祭 时间: 2016-9-30 08:52
请问楼主，你是要进行频率的续算吗？是的话续算的关键词是什么呢？因为太耗时所以经常出现在指定时间内算不完的情况

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-30 09:05

三石草祭发表于 2016-9-30 08:52
请问楼主，你是要进行频率的续算吗？是的话续算的关键词是什么呢？因为太耗时所以经常出现在指定时间内算不 ...

gjf文件内容：
%rwf=1.rwf
%nosave
%chk=1.chk
# restart

restart之后空两行，再无其他内容。
注释：1为任务名字，将rwf文件，gjf文件（如果用服务器，还有脚本文件）放到同一个目录下，提交任务即可。

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-30 09:09

believeht 发表于 2016-9-29 21:32
打开.out文件，第4-6行应该为下列内容：
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -s ...

请问在任务提交后，运行了10小时候依然是如下情况，何解？
******************************************
Gaussian 09:  EM64L-G09RevA.01  8-May-2009
            29-Sep-2016
******************************************
%rwf=abc.rwf
%nosave
%chk=abc.chk
---------
# restart
---------
(Restarting at link 1002)
ILRest=       101.
      IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
      IDoAtm=1111111111111111111111111111
      Differentiating once with respect to electric field.
            with respect to dipole field.
      Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
      There are 237 degrees of freedom in the 1st order CPHF.  IDoFFX=5.
237 vectors produced by pass  0 Test12= 1.28D-13 1.00D-09 XBig12= 2.43D+03 2.93D+01.
AX will form 27 AO Fock derivatives at one time.

作者
Author: 三石草祭 时间: 2016-9-30 11:18

Aristotler 发表于 2016-9-30 09:05
gjf文件内容：
%rwf=1.rwf
%nosave

谢谢，我尝试一下

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-30 11:50

Aristotler 发表于 2016-9-30 09:09
请问在任务提交后，运行了10小时候依然是如下情况，何解？
***************************************** ...

如果明显超过理应的计算耗时，就停了重算
如果没超，继续等

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-30 14:22

sobereva 发表于 2016-9-30 11:50
如果明显超过理应的计算耗时，就停了重算
如果没超，继续等

感谢大神回复，谢谢

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-9-30 16:10

sobereva 发表于 2016-9-30 11:50
如果明显超过理应的计算耗时，就停了重算
如果没超，继续等

大神，本人算的分子是卟啉，78个原子，之前在天河上运行过2天（用户限制）掉下来了，用到您说的续点地方法，在服务器上继续分析，得到如上情况。现在的时间也是17个小时了。这样的情况超过了理应的计算耗时吗？（b3lyp 6-31g(d) )请问重算是不是还会这样？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-30 17:18

Aristotler 发表于 2016-9-30 16:10
大神，本人算的分子是卟啉，78个原子，之前在天河上运行过2天（用户限制）掉下来了，用到您说的续点地方 ...

天河没用过。
你最好重新算一次，写上#P以便监控输出，省得卡住也不知道什么情况
这种体系这种级别算freq不至于特别耗时

作者
Author: Aristotler 时间: 2016-10-2 15:34

sobereva 发表于 2016-9-30 17:18
天河没用过。
你最好重新算一次，写上#P以便监控输出，省得卡住也不知道什么情况
这种体系这种级别算fr ...

好的，大神，我尝试一下，感谢您

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