计算化学公社

标题: 求助：如何把.xyz文件转化为.gro文件 [打印本页]

作者
Author: 孜宸润泽 时间: 2023-12-2 22:21
标题: 求助：如何把.xyz文件转化为.gro文件
我想做一个石墨烯的gro文件，此前获得了包含需求的石墨烯坐标文件gra_21.xyz文件，现在想转化为gro文件。
本人不是特别了解怎么转化，求助大佬们，希望能指点指点。
下面是我的xyz文件

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-3 00:22
Multiwfn载入xyz文件，主功能100的子功能2选相应选项导出成gro
xyz文件本身不定义盒子信息，如果需要把盒子信息也传递给Multiwfn使得导出的gro文件里也有盒子信息，按下文说的自行修改xyz文件的注释行加入盒子信息
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）

(9)含有晶胞信息的xyz文件。这是我自己定义的，如果xyz文件的注释行（第二行）包含诸如以下形式的内容（以埃为单位的平移矢量），就会被Multiwfn读取
Tv_1: 7.426 0.0 0.0 Tv_2: 3.6 6 6.40 0.0 Tv_3: 0.0 0.0 10.0
也可以按照extended xyz格式的方式在xyz文件的第二行记录晶胞信息，例如：
Lattice="7.426 0.0 0.0 -3.66 6.40 0.0 0.0 0.0 10.0"

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