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标题: 结构优化Error in internal coordinate system. [打印本页]

作者
Author: lei234 时间: 2023-12-5 11:13
标题: 结构优化Error in internal coordinate system.
结构如图，分别尝试过优化上面的分子和下面的分子，分开都可以正常结束，放在一起总是提示Error in internal coordinate system.关键字opt=(cartesian,notrust,gdiis) 6-31g(d) m062x。请高手指教，多谢！
优化前：
(, 下载次数 Times of downloads: 6)
跑了22步：
(, 下载次数 Times of downloads: 5)

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-5 15:13
初始结构两部分离那么远干嘛
既然同时优化，就必然想要得到复合的结构，一开始离那么远可能导致受力过小，老也结合不到一起去；就算最后结合到一起去了，也会浪费大量步数
此外，这种体系用DFT优化前，用GFN-xTB或半经验预优化能节约巨量时间

这种体系也根本就不应该直接这么优化，得到的几乎一定是能量较高的复合物结构。应当做构型搜索，参考
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

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