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标题: 求助：虚拟机安装gromcas2018发生报错 [打印本页]

作者
Author: 金丹老祖 时间: 2023-12-5 11:14
标题: 求助：虚拟机安装gromcas2018发生报错
我是按照卢老师的教程做的（http://sobereva.com/457）
安装cmske3 和安装 FFTW库都正常，但是安装gmx的最后一步 make install 发生如下报错

报错内容如下：
/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/awh/biasparams.cpp:137:62: 错误：‘numeric_limits’不是‘std’的成员
  137 |       GMX_RELEASE_ASSERT(gridAxis[d].length()/sigma < std::numeric_limits<int>::max(), "The axis length in units of sigma should fit in an int");
   |                                                          ^~~~~~~~~~~~~~

/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/utility/gmxassert.h:67:15: 附注：in definition of macro ‘GMX_RELEASE_ASSERT’
67 |    ((void) ((condition) ? (void)0 : \
   |             ^~~~~~~~~
/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/awh/biasparams.cpp:137:77: 错误：expected primary-expression before ‘int’
  137 | ASE_ASSERT(gridAxis[d].length()/sigma < std::numeric_limits<int>::max(), "The axis length in units of sigma should fit in an int");
   |                                                          ^~~

/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/utility/gmxassert.h:67:15: 附注：in definition of macro ‘GMX_RELEASE_ASSERT’
67 |    ((void) ((condition) ? (void)0 : \
   |             ^~~~~~~~~
/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/awh/biasparams.cpp:137:77: 错误：expected ‘)’ before ‘int’
  137 | ASE_ASSERT(gridAxis[d].length()/sigma < std::numeric_limits<int>::max(), "The axis length in units of sigma should fit in an int");
   |                                                          ^~~

/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/utility/gmxassert.h:67:15: 附注：in definition of macro ‘GMX_RELEASE_ASSERT’
67 |    ((void) ((condition) ? (void)0 : \
   |             ^~~~~~~~~
/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/utility/gmxassert.h:67:14: 附注：to match this ‘(’
67 |    ((void) ((condition) ? (void)0 : \
   |             ^
/root/下载/sob/gromacs-2018.8/src/gromacs/awh/biasparams.cpp:137:9: 附注：in expansion of macro ‘GMX_RELEASE_ASSERT’
  137 |       GMX_RELEASE_ASSERT(gridAxis[d].length()/sigma < std::numeric_limits<int>::max(), "The axis length in units of sigma should fit in an int");
   |       ^~~~~~~~~~~~~~~~~~
/root/下载/sob

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-5 15:15
把软件环境（操作系统、gcc版本）交代清楚

gromacs、cmake都没拼对

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-5-2 00:01
半年后再看，不知楼主是否解决此问题，不过还是转载下gromacs论坛某讨论帖的措施：

加 #include <limits> 到 src/gromacs/awh/biasparams.cpp 和 src/gromacs/mdlib/minimize.cpp 两个文件的顶部

为参加这几天的分子动力学培训班，我在win 11笔记本的VMware 16.1.1上Rocky Linux 9.3虚拟机中用gcc 11.4.1编译GROMACS 2018.8，也遇到同样的以" 'numeric_limits' is not a member of 'std' "开头的一串报错，按上述方法修改后即可成功编译。

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