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标题: ORCA做振动分析经常卡在Dipole derivatives这一步 [打印本页]

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Author: Cadmus 时间: 2023-12-14 08:38
标题: ORCA做振动分析经常卡在Dipole derivatives这一步
各位老师，我做了一个约160个原子的DNA单链分子的优化+振动分析，关键词如下：! B97-3c GDIIS-OPT freq tightSCF miniprint nopop TIGHTOPT CPCM(Water) ，但是有时候会经常卡在Dipole derivatives这一步（有些时候就不会卡住，运行时间大概在6个小时，卡住的话两天都还没运行完，并且目录下的tmp文件也不更新），请问这种情况应该如何解决？out文件的最后几行如下：

IBatch 7 (of 9)
   CP-SCF ITERATION 0: 1.1054e+00 ( 147.7 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 1: 7.6812e-02 ( 155.3 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 2: 2.2156e-02 ( 154.3 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 3: 7.3177e-03 ( 155.9 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 4: 2.8601e-03 ( 157.3 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 5: 1.2252e-03 ( 157.9 sec 1/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 6: 4.6397e-04 ( 155.1 sec  22/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 7: 1.5516e-04 ( 105.4 sec  57/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 8: 4.4898e-05 (  19.1 sec  59/ 59 done)
                  *** THE CP-SCF HAS CONVERGED ***
IBatch 8 (of 9)
   CP-SCF ITERATION 0: 6.2279e-01 ( 147.6 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 1: 5.1464e-02 ( 151.0 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 2: 2.2066e-02 ( 153.7 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 3: 5.8582e-03 ( 154.0 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 4: 2.1854e-03 ( 154.9 sec 0/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 5: 7.5406e-04 ( 156.3 sec 8/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 6: 3.3185e-04 ( 137.6 sec  43/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 7: 1.2092e-04 (  53.1 sec  57/ 59 done)
   CP-SCF ITERATION 8: 3.8802e-05 (  18.4 sec  59/ 59 done)
                  *** THE CP-SCF HAS CONVERGED ***
IBatch 9 (of 9)
   CP-SCF ITERATION 0: 3.3921e-01 (  32.0 sec 0/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 1: 2.8433e-02 (  32.7 sec 0/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 2: 1.1518e-02 (  32.9 sec 0/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 3: 2.5162e-03 (  33.6 sec 0/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 4: 8.0982e-04 (  33.7 sec 0/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 5: 2.6673e-04 (  33.6 sec 1/  8 done)
   CP-SCF ITERATION 6: 8.2859e-05 (  31.8 sec 8/  8 done)
                  *** THE CP-SCF HAS CONVERGED ***

                                             ... done ( 9834.7 sec)
Forming perturbed density Hessian contributions  ... done (    43.1 sec)
Calculating [Q*(d^2 A/dXdY)*Q  ] C-PCM term    ... done (    0.1 sec)
Calculating [d^2(V_N)/(dXdY)*Q ] C-PCM term    ... done (    0.0 sec)
Calculating [d^2(V_el)/(dXdY)*Q] C-PCM term    ... done (    10.5 sec)
Calculating C-PCM term that depends on dQ/dX    ... done (    10.8 sec)
2nd integral derivative contribs (SHARK-RI)    ... done ( 1204.5 sec)
Exchange-correlation Hessian                   ... done ( 165.3 sec)
Dispersion correction in the Hessian          ... done (    12.2 sec)
SRB correction in the Hessian                   ... done (    0.1 sec)
Dipole derivatives                            ...

作者
Author: dnlx 时间: 2023-12-14 20:03
每核内存是多少？

作者
Author: Cadmus 时间: 2023-12-15 08:33

dnlx 发表于 2023-12-14 20:03
每核内存是多少？

每核的内存给了10000MB，一共36个核

作者
Author: Cadmus 时间: 2023-12-15 11:03
我将体系换成一个单个水分子，尝试把泛函换成r2SCAN-3c，或者把ORCA版本降为5.0.3，都出现了同样的问题

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-12-15 11:18

Cadmus 发表于 2023-12-15 11:03
我将体系换成一个单个水分子，尝试把泛函换成r2SCAN-3c，或者把ORCA版本降为5.0.3，都出现了同样的问题

建议上ORCA官方论坛反映

作者
Author: Cadmus 时间: 2023-12-15 11:24

zjxitcc 发表于 2023-12-15 11:18
建议上ORCA官方论坛反映

好的，我刚看到ORCA论坛上反映了类似的问题，但开发者还没回复，现在numfreq还算稳定，就是运算时间相对来说比较长

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