计算化学公社

标题: 关于画ELF图的咨询 [打印本页]

作者
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XiaoZeng    时间: 2023-12-14 09:36
标题: 关于画ELF图的咨询
想咨询一下各位老师:1、我根据操作手册进行ELF图操作,选取三个原子定义平面来观察他们周围的电子密度,想要在地图上显示所有的原子标签,对我的体系进行操作,按我计算的Mayer键分析有一部分应该也有键连接(或者说有共价键,因为所得的Mayer键小于1大于0.5),如下图我标出的地方,但是ELF图没有显示,是我的操作有误,还是那里是不成键的.
2、这么多原子的ELF是怎么操作得到的

作者
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乐平    时间: 2023-12-14 10:48
首先,你计算的体系是什么分子?

其次,你的选取的平面是否能包含你标记的所谓的“未成键”原子?

请回忆高中《立体几何》的知识:三个点能确定一个平面。
但是这个平面不代表能包含你计算体系的所有原子,除非你计算的分子中所有的原子都在同一平面内。

ELF 只能展示你所选取的平面,不在你选的平面内的原子,当然没法显示了。

作者
Author:
XiaoZeng    时间: 2023-12-14 11:19
乐平 发表于 2023-12-14 10:48
首先,你计算的体系是什么分子?

其次,你的选取的平面是否能包含你标记的所谓的“未成键”原子?

好的老师,我明白您的意思了,我的体系是V掺杂硼团簇,请问一下老师有什么方法确定原子在不在某一个平面吗,还是只能靠自己操作尝试
作者
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乐平    时间: 2023-12-14 11:52
XiaoZeng 发表于 2023-12-14 11:19
好的老师,我明白您的意思了,我的体系是V掺杂硼团簇,请问一下老师有什么方法确定原子在不在某一个平面 ...

你换个角度,从侧面就能看到是不是在同一平面内啊……

选你要观察的几个原子作为研究对象。
作者
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sobereva    时间: 2023-12-14 12:59
Multiwfn主功能0看分子结构,自然知道哪些原子在一个平面上

仔细看此文4.2节
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
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XiaoZeng    时间: 2023-12-14 13:47
sobereva 发表于 2023-12-14 12:59
Multiwfn主功能0看分子结构,自然知道哪些原子在一个平面上

仔细看此文4.2节

好的好的,谢谢sob老师
作者
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XiaoZeng    时间: 2023-12-14 13:47
乐平 发表于 2023-12-14 11:52
你换个角度,从侧面就能看到是不是在同一平面内啊……

选你要观察的几个原子作为研究对象。

好的老师,我去试试




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