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标题: GROMACS均相体系产生相模拟压力变化过大 [打印本页]

作者
Author: wangyueda 时间: 2023-12-14 23:54
标题: GROMACS均相体系产生相模拟压力变化过大
请问下各位老师，我在做GROMACS液相体系产生相模拟时，发现模拟过程中体系压力变化较大，如图所示，控压部分关键词如下：

Pcoupl = parrinello-rahman
pcoupltype = isotropic
tau_p = 5.0
ref_p = 1.0
compressibility = 4.5e-5

复制代码

这问下这正常吗？这种压力的波动会对模拟结果带来啥不利的影响吗？

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2023-12-15 02:22
正常的，你体系大点波动就小些

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-15 09:36
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

(, 下载次数 Times of downloads: 12)

作者
Author: wangyueda 时间: 2023-12-15 12:52

喵星大佬发表于 2023-12-15 02:22
正常的，你体系大点波动就小些

好的谢谢老师

作者
Author: wangyueda 时间: 2023-12-15 12:52

sobereva 发表于 2023-12-15 09:36
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

...

谢谢卢老师，我回去翻讲义

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