计算化学公社

标题: xtb固定非氢原子优化,结构跑散了 [打印本页]

作者
Author:
2532251334    时间: 2023-12-16 16:35
标题: xtb固定非氢原子优化,结构跑散了
1. 请问各位老师,我想优化一个晶体中提取出来的复合物结构,相拥xtb只优化氢原子,结果结构全部跑散了,之间离的特别远。
2.因为我的体系是带正电的所以就把阴离子补上,但是补阴离子也是从晶体中直接选的,还是固定非氢原子结果结构全弯了。
输入都是这个xtb 1.xyz -I 1 --opt tight -c 16 -u 0 --gfn 2 想问下这种情况应该怎么设置?
3.还有第三个问题就是要是在优化A,B两个分子通过弱相互作用结合在一起的时候,初始的结构应该怎么摆放,有没有什么技巧?
谢谢大家!





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3