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标题: 求助使用gmx_MMPBSA计算熵,σ(Int. Energy) > 3.6怎么解决 [打印本页]

作者
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lzy233    时间: 2023-12-18 12:33
标题: 求助使用gmx_MMPBSA计算熵,σ(Int. Energy) > 3.6怎么解决
  1. Normal [ -TΔS ]
  2. ENTROPY RESULTS (INTERACTION ENTROPY):
  3. Energy Method          Entropy σ(Int. Energy)    Average           SD        SEM
  4. -------------------------------------------------------------------------------
  5. GB                          IE          4.22      14.37         2.78       0.06

  6. -------------------------------------------------------------------------------
  7. -------------------------------------------------------------------------------
  8. WARNING: THE INTERACTION ENERGY STANDARD DEVIATION [ σ(Int. Energy) ]
  9. IS GREATER THAN 3.6 kcal/mol (~15 kJ/mol). THUS, THE INTERACTION ENTROPY VALUES ARE
  10. NOT RELIABLE. CHECK THIS PAPER FOR MORE INFO (https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00374)
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使用gmx_MMPBSA计算熵,σ(Int. Energy) > 3.6怎么解决?
作者
Author:
lmtt    时间: 2025-5-17 09:03
你好,请问解决了吗?我也遇到了这个问题

作者
Author:
jackshoulder    时间: 2025-5-19 10:58
建议你贴上mmpbsa.in文化作为参数文件进行详细分析,很大可能是你的参数设置不正确,导致。




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