计算化学公社

标题: 过渡态TS优化报错l9999求助,往上找具体错误原因时并未找到opt stopped [打印本页]

作者
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swyrzsyf    时间: 2023-12-18 17:38
标题: 过渡态TS优化报错l9999求助,往上找具体错误原因时并未找到opt stopped
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图为初猜过渡态结构(左)和产物(右)
刚入门,在优化过渡态的时候出现了很多种类的错误,都在公社中一一找到并解决了,但每次都有新的问题出现。
经常优化的时候我发现有些键会莫名其妙断掉。
这次的问题就是out文件报错l9999,并且向上搜索opt stopped并没有搜索到,只找到一个opt aborted,也看了优化曲线,没有震荡的情况。

我想知道是我初猜的有问题吗?我这个反应就是想计算氧自由基进攻碳碳双键形成环氧的一个过程。
所用的基组为#p opt=(calcfc,ts,maxcyc=500,noeigen,cartesian) freq ub3lyp/6-31g(d,p),电荷和自旋多重度为0 3。
gjf文件和报错的out文件如下,麻烦老师帮我看看,谢谢。
(, 下载次数 Times of downloads: 22)

作者
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Yaocy    时间: 2023-12-18 20:18
  1.          Item               Value     Threshold  Converged?
  2. Maximum Force            0.024277     0.000450     NO
  3. RMS     Force            0.007693     0.000300     NO
  4. Maximum Displacement     0.000000     0.001800     YES
  5. RMS     Displacement     0.000000     0.001200     YES
  6. Predicted change in Energy= 0.000000D+00
  7. Optimization aborted.
  8.    -- No acceptable step.
复制代码


输出文件中有这一段,看来几何优化没有收敛,而且对应的 -DE/DX 也有很多星号
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sobereva    时间: 2023-12-18 21:03
过渡态初猜太糟糕
而且应当当单重态来算
没必要写cartesian

作者
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swyrzsyf    时间: 2023-12-19 08:46
sobereva 发表于 2023-12-18 21:03
过渡态初猜太糟糕
而且应当当单重态来算
没必要写cartesian

那请问初猜应该是怎样的呢?
三重态是因为我觉得有个氧自由基所以用三重态算的
好的,我把cartesian删掉试试
作者
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swyrzsyf    时间: 2023-12-19 08:47
Yaocy 发表于 2023-12-18 20:18
输出文件中有这一段,看来几何优化没有收敛,而且对应的 -DE/DX 也有很多星号

那您知道这种情况应该怎样去尝试解决吗?或者说朝哪个方向去修改试错呢?
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sobereva    时间: 2023-12-19 12:30
swyrzsyf 发表于 2023-12-19 08:46
那请问初猜应该是怎样的呢?
三重态是因为我觉得有个氧自由基所以用三重态算的
好的,我把cartesian删 ...

不牵扯反应的区域,显然不该有奇怪的键长、诡异的结构扭曲。结合基本结构化学常识判断
并且先把产物优化出来,基于产物的结构去调整结构得到过渡态初猜,这样容易得多
单个氧是三重态,绝对不代表过渡态时候是三重态。单个氧是三重态是因为2p原子轨道简并,然而在过渡态时氧已经部分成键了,简并性显然会破坏
作者
Author:
swyrzsyf    时间: 2023-12-19 14:11
sobereva 发表于 2023-12-19 12:30
不牵扯反应的区域,显然不该有奇怪的键长、诡异的结构扭曲。结合基本结构化学常识判断
并且先把产物优化 ...

好的,我明白了,我去再试试,谢谢老师。
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swyrzsyf    时间: 2023-12-20 09:36
本帖最后由 swyrzsyf 于 2023-12-20 09:42 编辑
swyrzsyf 发表于 2023-12-19 14:11
好的,我明白了,我去再试试,谢谢老师。

成功计算出来了
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swyrzsyf    时间: 2023-12-20 09:38
sobereva 发表于 2023-12-19 12:30
不牵扯反应的区域,显然不该有奇怪的键长、诡异的结构扭曲。结合基本结构化学常识判断
并且先把产物优化 ...

接过渡态优化问题,上次经过初猜修正后重新进行TS计算,这次能够成功计算出输出文件了,在这里谢谢老师的指导,点一下就把我自个研究一个周的困惑解决了。
但是现在出现了一个新的问题。
最终得到的结果只有一个虚频,但是该虚频振动并不对应我的反应方向,而是甲基自己在旋转。
如下图左为我初猜结构,图右是过渡态优化得到的最终结构(这对应上了我的目标生成物......)

(, 下载次数 Times of downloads: 10)
想请教下虚频不是我要的虚频这种情况是什么原因产生的呢?应该怎么解决呢?
输入文件和输出文件如下
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

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sobereva    时间: 2023-12-21 03:13
swyrzsyf 发表于 2023-12-20 09:38
接过渡态优化问题,上次经过初猜修正后重新进行TS计算,这次能够成功计算出输出文件了,在这里谢谢老师的 ...

初猜结构不当,优化到了无意义的过渡态




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