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标题: tip4p-ice.itp水模型放到不同力场如何修改参数？ [打印本页]

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Author: moni0823 时间: 2023-12-20 10:00
标题: tip4p-ice.itp水模型放到不同力场如何修改参数？
各位老师同学好，想问大家一下，sob老师的这个tip4p-ice.itp的水模型，如果放到charmm力场当中，需要如何修改，是只需要将atomtypes改变一下嘛？比如之前是OW_ice，现在改成OWT4_ice，不知道这样做是否是正确的？
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作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-21 03:54
把当前itp文件里利用的自定义的原子类型加入到ffnonbonded.itp的[atomtypes]里

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Author: moni0823 时间: 2023-12-21 10:45

sobereva 发表于 2023-12-21 03:54
把当前itp文件里利用的自定义的原子类型加入到ffnonbonded.itp的[atomtypes]里

老师，我可不可以这样理解，名字是无所谓的，比如OW_ice和OWT4_ice都是一样的，主要是将后面的参数导入ffnonbonded.itp的[atomtypes]里。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-22 01:43

moni0823 发表于 2023-12-21 10:45
老师，我可不可以这样理解，名字是无所谓的，比如OW_ice和OWT4_ice都是一样的，主要是将后面的参数导入ff ...

原子类型名字随便起（但至少别和已有的冲突），只要当前水模型里的原子类型在[atomtypes]里添加进行定义就行了

作者
Author: moni0823 时间: 2023-12-22 11:15

sobereva 发表于 2023-12-22 01:43
原子类型名字随便起（但至少别和已有的冲突），只要当前水模型里的原子类型在[atomtypes]里添加进行定义 ...

好的，谢谢sob老师

作者
Author: 动力学 时间: 2024-4-14 16:02

sobereva 发表于 2023-12-22 01:43
原子类型名字随便起（但至少别和已有的冲突），只要当前水模型里的原子类型在[atomtypes]里添加进行定义 ...

您好老师，您的tip4p-ice.itp的参数设置来源于哪里

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-15 06:15

动力学发表于 2024-4-14 16:02
您好老师，您的tip4p-ice.itp的参数设置来源于哪里

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里我直接提供了我写的itp文件，本论坛里可能之前我也分享过，首页google框搜。如果你是指里面的具体值来自哪里，去看TIP4P-ice水模型原文。

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