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标题: 关于editconf命令添加盒子用-d的问题 [打印本页]

作者
Author: xuxu 时间: 2023-12-20 11:25
标题: 关于editconf命令添加盒子用-d的问题
请问下大家，gromacs用editconf命令添加盒子的时候选择了-d 1.2，但是看生成的pdb中原子有贴在盒子边界处的，-d不是指原子到盒子边界的最小距离小于1.2nm吗？为什么还会出现这种情况呢？我用的三斜盒子

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-21 03:46
用矩形盒子

作者
Author: xuxu 时间: 2023-12-21 10:37

sobereva 发表于 2023-12-21 03:46
用矩形盒子

sob老师，我用了矩形盒子以后也会出现这种情况呢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-22 01:42

xuxu 发表于 2023-12-21 10:37
sob老师，我用了矩形盒子以后也会出现这种情况呢

把输入文件上传，贴出你的editconf定义矩形盒子的命令，以及得到的文件

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