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标题: 多原子阴离子怎么计算msd？ [打印本页]

作者
Author: linyushuang 时间: 2023-12-20 16:19
标题: 多原子阴离子怎么计算msd？
请问一下，cp2k模拟完轨迹之后怎么对阴离子计算msd。比如Zn离子计算msd的时候只有一个原子，很好定义。而SO4离子应该怎么定义呢，是将SO4这五个原子定义为一个整体，还是可以直接用其中的某一个原子计算msd呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-21 03:39
用S计算就行了

作者
Author: linyushuang 时间: 2023-12-21 10:43

sobereva 发表于 2023-12-21 03:39
用S计算就行了

社长，那如果是像OTF-（三氟甲基磺酸锌）这样的离子呢，是不是也取S计算也可以的？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-22 01:42

linyushuang 发表于 2023-12-21 10:43
社长，那如果是像OTF-（三氟甲基磺酸锌）这样的离子呢，是不是也取S计算也可以的？

取一个靠中心的原子就行，或者对质心计算MSD。对于描述离子整体运动的效果基本一样

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