计算化学公社

标题: lammps模拟 .in文件系综设置 [打印本页]

作者
Author: davi 时间: 2023-12-20 22:47
标题: lammps模拟 .in文件系综设置
各位前辈好，刚接触lammps模拟，找到了一篇提供了.in文件lammps模拟文献，对于模拟的细节，大致如下。其进行了ACN(乙晴)的介电常数和粘度的计算。附上模拟细节时的原文。其大概意思是先用NPT系综进行平衡。求取介电常数时采用NVT系综；对于粘度，先是生成了50个不同速度的.in文件，之后采用了NVT系综。最后说了下控制温度和压力采用的方法。我对原文解释可能不太清楚，望大佬见谅。附上三张图片，第一个是文献模拟的细节，第二个是ACN粘度计算的.in文件，第三个为介电常数文件。本人有以下几个问题，还希望各位前辈能够指点一下：
1.首先是说的在298K下用NPT平衡，但是ACN粘度指定的温度是323K，是否不对；
2.其次，文献说了一个100ps来平衡是否指的时间，是否对应两个.in文件中fix NPT命令行中两个100.0？如果不是，怎么知道是否用了100ps来模拟
3.对于两个.in文件，我个人感觉模拟应该是有先后之分的吧，文献说了三个fix 系综流程，为何给的.in文件中对于fix 系综命令只保留了一条呢
4.为啥都把能量最小化给去掉了，即minimize那一行

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)