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标题: 求助:opls力场itp转成rtp使用pdb2gmx出现atom missing问题 [打印本页]

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Author: yulaile 时间: 2023-12-21 13:20
标题: 求助:opls力场itp转成rtp使用pdb2gmx出现atom missing问题
本帖最后由 yulaile 于 2023-12-23 11:44 编辑

各位老师好，我用一个寡聚物单体优化后，上传LigParGen下载得到itp文件。itp拆成三个rtp文件Q0,Q1,Q2放在oplsaa.ff目录，然后从itp文件提取atomtypes的信息添加到atomtypes.atp、ffnonbonded.itp中，运行pdb2gmx 出现atom missing的问题。请问各位老师是我编辑的文件格式问题还是操作步骤问题，谢谢各位老师

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