计算化学公社

标题: 求助:在进行分子能量最小化时1202.exe报错 [打印本页]

作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-21 16:02
标题: 求助:在进行分子能量最小化时1202.exe报错
输入文件是用chemdarw画的结构,导入chem3D之后产生的gjf文件(同时做了一批分子,其中几个报错)
附件分别是我的输入文件和输出文件
我查看了所有报错的文件都是在1202.exe这里报错
有没有大神可以帮我看一下是哪里出了问题,谢谢各位大佬

作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-21 16:05
补充一下,我是在linux系统下运行的所有文件,用的是g16
作者
Author:
pal    时间: 2023-12-21 16:11
所以为啥不直接用gview画结构呢,你这个输入文件原子都直接重叠在一起了
作者
Author:
Yaocy    时间: 2023-12-21 16:53
你的输入文件的原子间距离太小了,初猜结构不合理

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-12-22 01:54
0325-ddd 发表于 2023-12-21 16:05
补充一下,我是在linux系统下运行的所有文件,用的是g16

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

这种体系用gview画才是最快的,而且三维结构可以准确控制,用chemdraw完全是绕弯路
作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-22 10:18
pal 发表于 2023-12-21 16:11
所以为啥不直接用gview画结构呢,你这个输入文件原子都直接重叠在一起了

好的,感谢回复,我试试
作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-22 10:19
Yaocy 发表于 2023-12-21 16:53
你的输入文件的原子间距离太小了,初猜结构不合理

感谢回复,刚开始还不是很熟悉要怎么准确得搞这个输入文件,我试试gview
作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-22 10:21
sobereva 发表于 2023-12-22 01:54
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

谢谢sob老师提出的问题,我之后发帖注意
谢谢老师解答,我试试看能否解决问题
作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-22 23:18
0325-ddd 发表于 2023-12-22 10:21
谢谢sob老师提出的问题,我之后发帖注意
谢谢老师解答,我试试看能否解决问题

谢谢老师的回复,在初始结构没问题的情况下,整个分子是可以顺利跑完的
作者
Author:
0325-ddd    时间: 2023-12-22 23:19
0325-ddd 发表于 2023-12-22 10:19
感谢回复,刚开始还不是很熟悉要怎么准确得搞这个输入文件,我试试gview

谢谢大佬的回复,问题已解决,非常感谢




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3