计算化学公社

标题: 求用VMD计算蛋白质嵌入膜内深度的脚本 [打印本页]

作者
Author: 天田甜恬 时间: 2023-12-23 14:10
标题: 求用VMD计算蛋白质嵌入膜内深度的脚本
想求图里蛋白质最低点到生物膜最高点的距离

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-24 01:09
VMD里输入measure minmax [atomselect top 选择语句]，可以得到选择语句对应的区域的XYZ最小和最大值。对蛋白质部分和膜部分都这么测量，用膜的Z最大值减去蛋白质的Z最小值就完了。

如果不熟悉选择语句，看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)