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标题: 求助，如何在模拟过程中，控制多个分子总在膜体系的同一侧 [打印本页]

作者
Author: Jimili 时间: 2023-12-23 15:38
标题: 求助，如何在模拟过程中，控制多个分子总在膜体系的同一侧
本帖最后由 Jimili 于 2023-12-23 16:52 编辑

我想模拟一个多肽自组装体系与膜的作用，我希望多肽都是在膜的同一侧与膜接触的（不希望因为Z方向的周期性边界条件使得内外膜无法区分），所以希望如图所示的多肽总是在Z轴的0<Z<膜，这个范围内。请问GROMACS有什么方法可以实现吗？感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-24 01:00
用wall或者石墨烯挡住，或者扩出真空区

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