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标题: 有哪些量化软件比较适合计算多肽小分子的光谱图？ [打印本页]

作者
Author: ruanyang 时间: 2016-10-10 19:56
标题: 有哪些量化软件比较适合计算多肽小分子的光谱图？
想请教大家一个问题，我利用MD的方法跑一个  小分子的多肽，得到1000个初始的构型，我参考http://sobereva.com/165，这个帖子得到较为稳定的初始构型。
我的问题是：使用哪些量化软件可以很方便的计算  该物质的红外，拉曼，UV-Vis, ECD 和 VCD 光谱图？（PS：VASP 是否适合进行这类的计算）

Sob老师的http://sobereva.com/224 帖子中指出了如何使用 Multiwfn 根据计算结果绘制光谱图，不知道是否可以输出  二维的光谱图数据？

谢谢大家的回复！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-10-11 01:25
VASP派不上用场。Gaussian+Multiwfn就能很容易计算和绘制
不知道你说的二维光谱图数据具体指什么

作者
Author: ruanyang 时间: 2016-10-11 08:16
感谢Sob老师的回复，我所谓的二维光谱图类似于这种形式：参考这篇文献

作者
Author: sobereva 时间: 2016-10-11 13:19

ruanyang 发表于 2016-10-11 08:16
感谢Sob老师的回复，我所谓的二维光谱图类似于这种形式：参考这篇文献

看样子得用专用程序或者自己写，现成的量化上用的光谱绘制工具都做不到

作者
Author: ruanyang 时间: 2016-10-11 13:35
恩恩，多谢Sob老师的回复！

还有一个问题就是直接利用：高斯计算分子的振动频率，在根据输出结果编程处理是否可行？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-10-11 16:54

ruanyang 发表于 2016-10-11 13:35
恩恩，多谢Sob老师的回复！

还有一个问题就是直接利用：高斯计算分子的振动频率，在根据输出结果编程 ...

我没仔细看你的那种光谱图的原理是怎么弄的，如果需要利用各个结构下的正则频率数据，从高斯输出文件中提取是可以的。

作者
Author: ruanyang 时间: 2016-10-11 18:26
理解了Sob老师，感谢您的回复！

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