计算化学公社
标题:
gmx集群提交任务,动态库找不到
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作者Author:
linyushuang
时间:
2023-12-24 00:20
标题:
gmx集群提交任务,动态库找不到
本帖最后由 linyushuang 于 2023-12-24 00:22 编辑
请问下,我在集群提交gmx任务的时候出现了 gmx: error while loading shared libraries: libcufft.so.11: cannot open shared object file: No such file or directory 这个问题,后面我去找到了 ibcufft.so.11 的共享库,发现这个文件的owner是root账户,我是用普通用户提交的。后面我用root用户给这个文件增加了权限用的指令是 chmod 777 但还是会出现这个问题,这个应该怎么解决呢,是不是普通用户增加了权限还是无法访问这个库呀?
作者Author:
abin
时间:
2023-12-24 10:52
如果管理员或者软件工程师的职责范围包含,
协助用户处理应用软件运行相关事宜,
那么找管理员。
否则,你可能需要自己解决。
根据问题的描述来看,
你的操作,显示出,你对于集群是如何工作的不太了解。
最简单的处置措施,
让所有节点的系统镜像保持一致即可。
实现的方案很多,自己动手吧。
作者Author:
yoki_610
时间:
2023-12-24 10:57
提交脚本里加上export LD_LIBRARY_PATH=/libcufft.so.11的路径:$LD_LIBRARY_PATH
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