计算化学公社

标题: windows下gv生成的文件如何提交给linux平台的gaussian? [打印本页]

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lufenghxu    时间: 2016-10-10 23:03
标题: windows下gv生成的文件如何提交给linux平台的gaussian?
本人小白。安装了ubuntu,安装了gaussian09,但是不知道如何给g09提交任务。ubuntu下的计算结果CHK文件又在windows下如何打开。查了点文献,但是说的一头雾水,比如用dos2unix什么的。
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lufenghxu    时间: 2016-10-10 23:23
是不是可以将gv生成的.gjf文件先通过xftp上传到gaussian的主目录,然后g09<**.gif>**.out.有些说dos2unix又用在什么地方。
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sobereva    时间: 2016-10-11 01:31
lufenghxu 发表于 2016-10-10 23:23
是不是可以将gv生成的.gjf文件先通过xftp上传到gaussian的主目录,然后g09**.out.有些说dos2unix又用在什么 ...

gview保存输入文件,适当进行修改,然后传到有高斯的机子,用不着非得传到高斯主目录。
然后g09 < a.gjf > a.out。或者放后台运行nohup g09 < a.gjf > a.out &,这样通过exit登出服务器后任务还在服务器中运行。
对于目前版本,即便是windows下编写的gjf文件也用不着再用dos2unix转换了,老的高斯版本才需要这么先转换一下成为linux下的文本格式。
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lufenghxu    时间: 2016-10-11 08:16
sobereva 发表于 2016-10-11 01:31
gview保存输入文件,适当进行修改,然后传到有高斯的机子,用不着非得传到高斯主目录。
然后g09 < a.gjf ...

不保存到gaussian主目录,然后g09 < a.gjf > a.out,也可以执行?g09 < a.gjf > a.out后面没有&(&是干什么的)?
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lufenghxu    时间: 2016-10-11 08:29
还有个问题,后台运行和直接提交有什么(本人理解成前台)有什么区别?
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sobereva    时间: 2016-10-11 13:15
lufenghxu 发表于 2016-10-11 08:16
不保存到gaussian主目录,然后g09 < a.gjf > a.out,也可以执行?g09 < a.gjf > a.out后面没有&(&是干什 ...

Gaussian正常配置之后在哪个文件夹都可以直接用g09调用
&在linux中的用处google一搜就知道了
后台运行不会占着前台界面
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Mikasa    时间: 2016-10-11 21:08
放在主目录,估计是你没设置环境变量……感觉可以稍微补一下Linux的基本知识。
如果实在台式机上运行直接,g09 < xx.gif | tee xx.out ,这样可以监视输出
远程登录的话,g09 < xx.gif > xx.out & 放在后台运行。




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