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标题: 模拟密度随水含量先减小后增加，不符合规律 [打印本页]

作者
Author: qjy111 时间: 2023-12-25 15:33
标题: 模拟密度随水含量先减小后增加，不符合规律
各位老师好，最近遇到了一个问题，十分困扰我。我最近在模拟离子液体水溶液amber99sb.ff的密度。离子液体力场采用的是OPLS-AA,水拓扑文件是采用amber99sb.ff下的spce.itb,水的pdb文件是自己画的。首先利用packmol生成的盒子。首先对纯离子液体在不同温度下进行了密度模拟，都大于1且比实验密度小，误差在1%左右，随温度的变化是降低的，符合规律。然后对水密度进行模拟，都小于1且比实验密度小，误差在1%左右，随温度的变化是降低的，符合规律·。然后进行离子液体水溶液模拟，发现密度随水含量先减小后增加，按道理应该一直是随随水含量减小的，因为水的密度比离子液体小，混合一起水越多密度越小，但却出现了如图所示现象。求问这可能是什么原因造成的
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作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-26 03:55
既然你决定用OPLS-AA描述离子液体，就没有任何理由牵扯amber99sb.ff，直接用OPLS-AA力场目录下的水模型就完了。你这种描述没法不令人怀疑你的拓扑文件可能存在问题。

水模型用的是什么必须交代清楚。如果改了上面的不一致性后还有这个问题，尝试更好的水模型，比如TIP3P改成OPC。还不行可能mdp或模型有问题。

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