计算化学公社

标题: 石墨烯中C的电荷设置求助 [打印本页]

作者
Author: Olive.Lv 时间: 2023-12-25 17:05
标题: 石墨烯中C的电荷设置求助
我用vmd给packmol建的模型附电荷，C原子我附的是6，因为用vmd打开其他优化好的文件，查C的电荷显示的是6，但是我今天在一篇文献中看到说石墨烯的电荷设为0，请问这是为什么？

作者
Author: pal 时间: 2023-12-25 18:59
你说的是原子带的电子个数，他说的是c原子6个质子，6个电子，表现出来的是0

作者
Author: Olive.Lv 时间: 2023-12-25 20:28

pal 发表于 2023-12-25 18:59
你说的是原子带的电子个数，他说的是c原子6个质子，6个电子，表现出来的是0

那请问我vmd这个设置应该设为多少呢，还是6吗

作者
Author: pal 时间: 2023-12-25 20:30

Olive.Lv 发表于 2023-12-25 20:28
那请问我vmd这个设置应该设为多少呢，还是6吗

你设置电荷的最终目的是要做分子动力学还是干啥，感觉没理由用vmd去设置电荷

作者
Author: Olive.Lv 时间: 2023-12-25 20:43

pal 发表于 2023-12-25 20:30
你设置电荷的最终目的是要做分子动力学还是干啥，感觉没理由用vmd去设置电荷

我是用packmol建了一个模型，但是这个模型是不具备电荷还有半径等信息的，我想用vmd给附上这些信息，然后导出为data文件，放到lammps里面进行计算

作者
Author: pal 时间: 2023-12-25 20:50
那就都6呗，最后导出来的charge应该都是0

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)