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标题: PSI4做能量分解报错求助 [打印本页]

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Author: 2532251334 时间: 2023-12-26 11:13
标题: PSI4做能量分解报错求助
各位老师，我用sob老师经验贴 http://sobereva.com/526 使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算，安装了PSI4程序，运行后出现报错，查了论坛帖子可能是内存不够这里粘上虚拟机的设置，想请教大家我这个大概80个原子，得需要多大内存，另外可以机械硬盘上装虚拟机然后再装psi4吗？那是不是一开始就要把内存设置成很大比如1tB?

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-12-26 11:30
你这不像是内存不足，像是硬盘分区写满了，临时文件太大了。检查一下临时文件所在目录。如果你有设置$PSI_SCRATCH环境变量的话，那就在$PSI_SCRATCH/下。Windows下装虚拟机然后装Linux系统是一种办法，不过我个人不推荐虚拟机，建议直接使用Win10和11自带的Linux子系统WSL（需要开启WSL，网上教程一箩筐）。

作者
Author: 2532251334 时间: 2023-12-26 12:02

zjxitcc 发表于 2023-12-26 11:30
你这不像是内存不足，像是硬盘分区写满了，临时文件太大了。检查一下临时文件所在目录。如果你有设置$PSI_S ...

您好感谢回复，我的虚拟机大概只剩不到20个g，是不是临时文件写不下了。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-12-26 14:33

2532251334 发表于 2023-12-26 12:02
您好感谢回复，我的虚拟机大概只剩不到20个g，是不是临时文件写不下了。

在2L中已经说过了“检查一下临时文件所在目录”。手把手教学举例：
运行df -h查看所有分区，检查有无分区几乎被写满了，是否其含有$PSI_SCRATCH/目录。
若某个分区中目录较多，不知道哪个目录占用最多，可进入相应目录，运行du -h --max-depth=1查看哪个目录占用最多。

作者
Author: 2532251334 时间: 2023-12-26 17:08

zjxitcc 发表于 2023-12-26 14:33
在2L中已经说过了“检查一下临时文件所在目录”。手把手教学举例：
运行df -h查看所有分区，检查有无分 ...

老师我确认过了，是内存不够无法运行。后来我重新撞了个虚拟机分了很大的物理内存，然后用64G(电脑的极限）内存运行不会报错但是到后面内存一直99%占用但是CPU只有1%，换成32G内存后，运行到一半直接Killed任务就结束了，也没有报错，老师您知道咋回事吗？是不是我电脑算不了这个？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-26 23:37
这么大体系做SAPT极其占用资源，而且只能用最低阶的SAPT0，精度挺烂的
强烈建议用sobEDAw代替，不怎么占内存和硬盘，耗时低得多，精度也比SAPT0更好
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）

作者
Author: 2532251334 时间: 2023-12-27 14:20

sobereva 发表于 2023-12-26 23:37
这么大体系做SAPT极其占用资源，而且只能用最低阶的SAPT0，精度挺烂的
强烈建议用sobEDAw代替，不怎么占内 ...

老师我看到您的帖子了，我想求电荷转移项的成份，不知道您有写教程没？我好像没看到

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Author: zjxitcc 时间: 2023-12-27 22:51
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-12-27 22:52 编辑

2532251334 发表于 2023-12-26 17:08
老师我确认过了，是内存不够无法运行。后来我重新撞了个虚拟机分了很大的物理内存，然后用64G(电脑的极限 ...

我仍然坚持是你 PSI4临时文件所在的分区太小（注意，整个Linux系统有多大，与目标分区有多大，是两码事）

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Author: 2532251334 时间: 2023-12-28 21:41

zjxitcc 发表于 2023-12-27 22:51
我仍然坚持是你 PSI4临时文件所在的分区太小（注意，整个Linux系统有多大，与目标分区有多大，是两码事 ...

好的，谢谢老师解答，我再试试。

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