计算化学公社

标题: 求助：amber的align命令的使用方法 [打印本页]

作者
Author: molly85 时间: 2023-12-26 17:37
标题: 求助：amber的align命令的使用方法
各位老师们好，我想使用amber里的align命令将一个蛋白的后100帧叠合起来然后生成100个pdb文件，参考结构使用倒数第100帧的pdb，请问我应该怎么写命令，下面是amber里的align命令的解释
align <mask> [<refmask>] [move <mask>] [mass]
[ first | reference | ref <name> | refindex <#> | previous |
reftraj <name> [parm <name> | parmindex <#>] ]

作者
Author: 18217265596 时间: 2023-12-27 10:12
脚本每帧单独align
单独输出
循环99次

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)