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标题: 求助：检测PDB结构文件缺失结构 [打印本页]

作者
Author: Mengo 时间: 2023-12-28 15:56
标题: 求助：检测PDB结构文件缺失结构
各位老师好，我目前需要大规模的筛选一批PDB复合物晶体结构，请问各位老师是否有软件或者相关程序能够实现以下筛选工作：
1. 筛选晶体结构中缺少配体分子上的任何片段的复合物
2. 筛选距配体5Å 范围内缺少氨基酸骨架或侧链片段的复合物
3. 复合物中蛋白与配体之间存在明显的立体冲突（距离 < 2.0 Å）

感谢各位老师

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-29 04:53
通过自己写VMD tcl脚本很容易做到

作者
Author: Mengo 时间: 2024-2-2 23:51

sobereva 发表于 2023-12-29 04:53
通过自己写VMD tcl脚本很容易做到

好的，谢谢老师

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