计算化学公社

标题: 请教使用DFT判断化合物质子化位点的问题 [打印本页]

作者
Author:
286792125    时间: 2016-10-12 00:02
标题: 请教使用DFT判断化合物质子化位点的问题
本帖最后由 286792125 于 2016-10-12 00:01 编辑

各位老师好,本人做质谱分析,想利用计算化学验证化合物的碎片形成机制。
查阅一些文献,说分析质谱碎片需要先判断化合物的初始质子化位点。
(, 下载次数 Times of downloads: 27)

比如这个化合物,做正离子模式质谱分析,最可能的质子化位点有D-1和D-2。然后文中优化了结构并计算了D-1和D-2质子化后的能量。

(, 下载次数 Times of downloads: 24)


比较得出D1是质子化位点。
想请教各位老师,这个质子化位点是如何建模的?
是不是直接在原化合物的基础上,在D-1或D-2位点加一个氢?然后电荷数和多重度改为1 1,选择开壳层,就可以计算了?
(, 下载次数 Times of downloads: 32)
参考文献在附件中 (, 下载次数 Times of downloads: 35)

但我在网上看到计算亲和能和离子能的算法是:不在化合物上加H或者减H,直接改的电荷数和多重度。但是用这种方法无法判断复杂化合物的质子位点吧?比较疑惑,请老师帮忙,非常感谢!


作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2016-10-12 00:54
直接加减电荷(少、多一个电子)是电子亲和能和解离能;在合适的位置加氢是质子亲和能,对应不同的过程。比如EI里可能是前者,正离子ESI里可能就是后者了。

直接加氢,电荷+1多重度1就行了。选开壳层干啥。
作者
Author:
286792125    时间: 2016-10-12 10:07
liyuanhe211 发表于 2016-10-12 00:54
直接加减电荷(少、多一个电子)是电子亲和能和解离能;在合适的位置加氢是质子亲和能,对应不同的过程。比 ...

明白了 谢谢老师!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3